Protein–RNA interactions for Protein: P01736

T-cell receptor beta chain V region PHDS203 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01736 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01736 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01736 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01736 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01736 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01736 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01736 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01736 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01736 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01736 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01736 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01736 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01736 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01736 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01736 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01736 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01736 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01736 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01736 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01736 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01736 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01736 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01736 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01736 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01736 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01736 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01736 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01736 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01736 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01736 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01736 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01736 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01736 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01736 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01736 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01736 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01736 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01736 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01736 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01736 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01736 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01736 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01736 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01736 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01736 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01736 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01736 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01736 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01736 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01736 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01736 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01736 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01736 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01736 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01736 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01736 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01736 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01736 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01736 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01736 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01736 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01736 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01736 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01736 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01736 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01736 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01736 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01736 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01736 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01736 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01736 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01736 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01736 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01736 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01736 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01736 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01736 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01736 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01736 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
P01736 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01736 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01736 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01736 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01736 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01736 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01736 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01736 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01736 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01736 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01736 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01736 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
P01736 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01736 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01736 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01736 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01736 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01736 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01736 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01736 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01736 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms