Protein–RNA interactions for Protein: P01658

Ig kappa chain V-III region MOPC 321, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01658 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
P01658 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
P01658 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
P01658 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
P01658 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
P01658 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
P01658 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P01658 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
P01658 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P01658 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P01658 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P01658 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P01658 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
P01658 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
P01658 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P01658 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P01658 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
P01658 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P01658 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P01658 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P01658 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P01658 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P01658 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P01658 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
P01658 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01658 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01658 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01658 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01658 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P01658 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P01658 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P01658 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
P01658 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01658 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01658 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01658 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
P01658 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01658 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01658 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
P01658 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01658 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01658 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01658 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01658 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01658 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01658 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01658 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01658 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01658 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
P01658 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01658 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01658 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01658 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
P01658 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01658 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01658 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01658 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01658 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01658 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01658 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01658 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01658 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01658 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01658 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01658 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01658 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
P01658 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01658 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01658 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01658 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01658 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01658 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01658 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01658 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01658 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01658 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01658 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01658 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01658 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01658 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01658 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01658 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01658 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01658 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01658 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01658 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01658 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01658 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01658 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01658 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01658 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01658 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01658 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01658 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01658 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01658 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01658 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01658 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01658 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01658 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms