Protein–RNA interactions for Protein: O88809

Dcx, Neuronal migration protein doublecortin, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcxO88809 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
DcxO88809 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DcxO88809 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DcxO88809 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DcxO88809 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DcxO88809 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DcxO88809 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DcxO88809 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DcxO88809 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DcxO88809 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DcxO88809 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DcxO88809 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DcxO88809 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DcxO88809 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DcxO88809 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DcxO88809 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DcxO88809 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DcxO88809 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DcxO88809 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
DcxO88809 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DcxO88809 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DcxO88809 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DcxO88809 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DcxO88809 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DcxO88809 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DcxO88809 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DcxO88809 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DcxO88809 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DcxO88809 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DcxO88809 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DcxO88809 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DcxO88809 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DcxO88809 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DcxO88809 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DcxO88809 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DcxO88809 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DcxO88809 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DcxO88809 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DcxO88809 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DcxO88809 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DcxO88809 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DcxO88809 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DcxO88809 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DcxO88809 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DcxO88809 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DcxO88809 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DcxO88809 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DcxO88809 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DcxO88809 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DcxO88809 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DcxO88809 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DcxO88809 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DcxO88809 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DcxO88809 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DcxO88809 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DcxO88809 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DcxO88809 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DcxO88809 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DcxO88809 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DcxO88809 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DcxO88809 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DcxO88809 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DcxO88809 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DcxO88809 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DcxO88809 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DcxO88809 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DcxO88809 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DcxO88809 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DcxO88809 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DcxO88809 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DcxO88809 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
DcxO88809 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DcxO88809 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DcxO88809 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DcxO88809 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DcxO88809 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DcxO88809 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DcxO88809 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DcxO88809 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DcxO88809 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DcxO88809 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DcxO88809 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DcxO88809 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DcxO88809 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DcxO88809 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DcxO88809 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DcxO88809 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DcxO88809 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DcxO88809 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DcxO88809 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DcxO88809 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DcxO88809 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DcxO88809 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DcxO88809 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DcxO88809 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DcxO88809 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DcxO88809 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DcxO88809 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DcxO88809 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DcxO88809 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms