Protein–RNA interactions for Protein: O88532

Zfr, Zinc finger RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfrO88532 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ZfrO88532 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ZfrO88532 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZfrO88532 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZfrO88532 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZfrO88532 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZfrO88532 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZfrO88532 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZfrO88532 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZfrO88532 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZfrO88532 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZfrO88532 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZfrO88532 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25■■□□□ 1.59
ZfrO88532 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZfrO88532 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZfrO88532 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZfrO88532 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZfrO88532 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZfrO88532 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZfrO88532 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZfrO88532 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZfrO88532 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZfrO88532 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZfrO88532 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZfrO88532 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZfrO88532 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZfrO88532 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZfrO88532 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZfrO88532 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZfrO88532 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZfrO88532 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZfrO88532 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ZfrO88532 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZfrO88532 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZfrO88532 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZfrO88532 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZfrO88532 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ZfrO88532 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ZfrO88532 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZfrO88532 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZfrO88532 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZfrO88532 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZfrO88532 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZfrO88532 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZfrO88532 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZfrO88532 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZfrO88532 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZfrO88532 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZfrO88532 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZfrO88532 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZfrO88532 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZfrO88532 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZfrO88532 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZfrO88532 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZfrO88532 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZfrO88532 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZfrO88532 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZfrO88532 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZfrO88532 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZfrO88532 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZfrO88532 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZfrO88532 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZfrO88532 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZfrO88532 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZfrO88532 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZfrO88532 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZfrO88532 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZfrO88532 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZfrO88532 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZfrO88532 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZfrO88532 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZfrO88532 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZfrO88532 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZfrO88532 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZfrO88532 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZfrO88532 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZfrO88532 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZfrO88532 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZfrO88532 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZfrO88532 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZfrO88532 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZfrO88532 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZfrO88532 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZfrO88532 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZfrO88532 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZfrO88532 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZfrO88532 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZfrO88532 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZfrO88532 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZfrO88532 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZfrO88532 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZfrO88532 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZfrO88532 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZfrO88532 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZfrO88532 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZfrO88532 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZfrO88532 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZfrO88532 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZfrO88532 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZfrO88532 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms