Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vti1bO88384 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vti1bO88384 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vti1bO88384 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vti1bO88384 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vti1bO88384 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vti1bO88384 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vti1bO88384 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vti1bO88384 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vti1bO88384 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vti1bO88384 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vti1bO88384 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Vti1bO88384 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vti1bO88384 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vti1bO88384 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vti1bO88384 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vti1bO88384 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vti1bO88384 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vti1bO88384 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vti1bO88384 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vti1bO88384 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vti1bO88384 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vti1bO88384 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vti1bO88384 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vti1bO88384 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vti1bO88384 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vti1bO88384 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vti1bO88384 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vti1bO88384 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vti1bO88384 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vti1bO88384 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vti1bO88384 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vti1bO88384 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vti1bO88384 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vti1bO88384 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Vti1bO88384 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vti1bO88384 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vti1bO88384 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vti1bO88384 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vti1bO88384 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vti1bO88384 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Vti1bO88384 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vti1bO88384 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vti1bO88384 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vti1bO88384 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vti1bO88384 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vti1bO88384 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vti1bO88384 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vti1bO88384 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vti1bO88384 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vti1bO88384 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vti1bO88384 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vti1bO88384 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vti1bO88384 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vti1bO88384 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vti1bO88384 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vti1bO88384 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vti1bO88384 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vti1bO88384 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vti1bO88384 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vti1bO88384 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vti1bO88384 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vti1bO88384 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vti1bO88384 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vti1bO88384 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vti1bO88384 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vti1bO88384 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vti1bO88384 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vti1bO88384 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vti1bO88384 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vti1bO88384 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vti1bO88384 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vti1bO88384 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vti1bO88384 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vti1bO88384 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vti1bO88384 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vti1bO88384 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vti1bO88384 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Vti1bO88384 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vti1bO88384 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vti1bO88384 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vti1bO88384 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vti1bO88384 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vti1bO88384 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vti1bO88384 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vti1bO88384 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vti1bO88384 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Vti1bO88384 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vti1bO88384 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vti1bO88384 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vti1bO88384 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vti1bO88384 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vti1bO88384 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vti1bO88384 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vti1bO88384 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vti1bO88384 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vti1bO88384 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vti1bO88384 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vti1bO88384 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vti1bO88384 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms