Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atp2a2O55143 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atp2a2O55143 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp2a2O55143 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp2a2O55143 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp2a2O55143 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp2a2O55143 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp2a2O55143 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp2a2O55143 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp2a2O55143 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atp2a2O55143 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atp2a2O55143 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atp2a2O55143 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atp2a2O55143 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp2a2O55143 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp2a2O55143 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp2a2O55143 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp2a2O55143 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atp2a2O55143 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp2a2O55143 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp2a2O55143 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp2a2O55143 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp2a2O55143 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp2a2O55143 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp2a2O55143 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp2a2O55143 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp2a2O55143 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp2a2O55143 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp2a2O55143 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp2a2O55143 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp2a2O55143 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp2a2O55143 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp2a2O55143 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp2a2O55143 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp2a2O55143 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp2a2O55143 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp2a2O55143 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp2a2O55143 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp2a2O55143 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp2a2O55143 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp2a2O55143 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp2a2O55143 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp2a2O55143 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp2a2O55143 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp2a2O55143 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp2a2O55143 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp2a2O55143 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp2a2O55143 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp2a2O55143 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp2a2O55143 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp2a2O55143 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp2a2O55143 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp2a2O55143 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp2a2O55143 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp2a2O55143 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp2a2O55143 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp2a2O55143 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp2a2O55143 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp2a2O55143 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp2a2O55143 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp2a2O55143 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp2a2O55143 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atp2a2O55143 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atp2a2O55143 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp2a2O55143 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp2a2O55143 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp2a2O55143 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp2a2O55143 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp2a2O55143 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp2a2O55143 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp2a2O55143 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp2a2O55143 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp2a2O55143 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp2a2O55143 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp2a2O55143 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp2a2O55143 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp2a2O55143 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp2a2O55143 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2a2O55143 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2a2O55143 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2a2O55143 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2a2O55143 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2a2O55143 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2a2O55143 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp2a2O55143 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp2a2O55143 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp2a2O55143 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp2a2O55143 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp2a2O55143 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp2a2O55143 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp2a2O55143 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp2a2O55143 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp2a2O55143 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp2a2O55143 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp2a2O55143 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp2a2O55143 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp2a2O55143 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp2a2O55143 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp2a2O55143 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp2a2O55143 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms