Protein–RNA interactions for Protein: O55112

Aff2, AF4/FMR2 family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff2O55112 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Aff2O55112 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Aff2O55112 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Aff2O55112 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Aff2O55112 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Aff2O55112 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Aff2O55112 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Aff2O55112 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aff2O55112 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aff2O55112 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aff2O55112 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Aff2O55112 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Aff2O55112 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Aff2O55112 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Aff2O55112 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aff2O55112 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aff2O55112 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aff2O55112 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aff2O55112 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aff2O55112 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aff2O55112 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aff2O55112 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aff2O55112 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aff2O55112 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aff2O55112 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aff2O55112 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Aff2O55112 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Aff2O55112 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Aff2O55112 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Aff2O55112 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Aff2O55112 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Aff2O55112 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Aff2O55112 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aff2O55112 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aff2O55112 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aff2O55112 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Aff2O55112 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Aff2O55112 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Aff2O55112 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Aff2O55112 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Aff2O55112 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Aff2O55112 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Aff2O55112 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Aff2O55112 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Aff2O55112 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Aff2O55112 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Aff2O55112 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Aff2O55112 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Aff2O55112 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aff2O55112 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aff2O55112 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Aff2O55112 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aff2O55112 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aff2O55112 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aff2O55112 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aff2O55112 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Aff2O55112 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Aff2O55112 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Aff2O55112 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Aff2O55112 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Aff2O55112 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Aff2O55112 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aff2O55112 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aff2O55112 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aff2O55112 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aff2O55112 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aff2O55112 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aff2O55112 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aff2O55112 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aff2O55112 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Aff2O55112 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aff2O55112 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aff2O55112 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aff2O55112 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aff2O55112 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aff2O55112 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aff2O55112 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aff2O55112 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aff2O55112 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aff2O55112 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aff2O55112 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Aff2O55112 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Aff2O55112 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Aff2O55112 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Aff2O55112 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aff2O55112 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aff2O55112 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Aff2O55112 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aff2O55112 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Aff2O55112 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Aff2O55112 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Aff2O55112 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Aff2O55112 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Aff2O55112 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aff2O55112 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Aff2O55112 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Aff2O55112 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Aff2O55112 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Aff2O55112 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aff2O55112 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms