Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Sema6bO54951 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Sema6bO54951 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Sema6bO54951 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Sema6bO54951 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Sema6bO54951 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Sema6bO54951 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Sema6bO54951 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Sema6bO54951 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Sema6bO54951 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Sema6bO54951 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Sema6bO54951 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Sema6bO54951 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Sema6bO54951 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
Sema6bO54951 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Sema6bO54951 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Sema6bO54951 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Sema6bO54951 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Sema6bO54951 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Sema6bO54951 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Sema6bO54951 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Sema6bO54951 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Sema6bO54951 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Sema6bO54951 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Sema6bO54951 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Sema6bO54951 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Sema6bO54951 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Sema6bO54951 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Sema6bO54951 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Sema6bO54951 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Sema6bO54951 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Sema6bO54951 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Sema6bO54951 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Sema6bO54951 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Sema6bO54951 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Sema6bO54951 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Sema6bO54951 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Sema6bO54951 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Sema6bO54951 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Sema6bO54951 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Sema6bO54951 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Sema6bO54951 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Sema6bO54951 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Sema6bO54951 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Sema6bO54951 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Sema6bO54951 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Sema6bO54951 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Sema6bO54951 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Sema6bO54951 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Sema6bO54951 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Sema6bO54951 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Sema6bO54951 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Sema6bO54951 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Sema6bO54951 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Sema6bO54951 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Sema6bO54951 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Sema6bO54951 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Sema6bO54951 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Sema6bO54951 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Sema6bO54951 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Sema6bO54951 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Sema6bO54951 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Sema6bO54951 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Sema6bO54951 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Sema6bO54951 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Sema6bO54951 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Sema6bO54951 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Sema6bO54951 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Sema6bO54951 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Sema6bO54951 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Sema6bO54951 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Sema6bO54951 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Sema6bO54951 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Sema6bO54951 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Sema6bO54951 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Sema6bO54951 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Sema6bO54951 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Sema6bO54951 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Sema6bO54951 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Sema6bO54951 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Sema6bO54951 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Sema6bO54951 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Sema6bO54951 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Sema6bO54951 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Sema6bO54951 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Sema6bO54951 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Sema6bO54951 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Sema6bO54951 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Sema6bO54951 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Sema6bO54951 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Sema6bO54951 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Sema6bO54951 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Sema6bO54951 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Sema6bO54951 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Sema6bO54951 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Sema6bO54951 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Sema6bO54951 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Sema6bO54951 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Sema6bO54951 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Sema6bO54951 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms