Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Limk2O54785 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Limk2O54785 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Limk2O54785 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Limk2O54785 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Limk2O54785 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Limk2O54785 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Limk2O54785 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Limk2O54785 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Limk2O54785 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Limk2O54785 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Limk2O54785 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Limk2O54785 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Limk2O54785 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Limk2O54785 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Limk2O54785 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Limk2O54785 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Limk2O54785 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Limk2O54785 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Limk2O54785 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Limk2O54785 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Limk2O54785 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Limk2O54785 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Limk2O54785 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Limk2O54785 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Limk2O54785 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Limk2O54785 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Limk2O54785 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Limk2O54785 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Limk2O54785 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Limk2O54785 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Limk2O54785 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Limk2O54785 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Limk2O54785 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Limk2O54785 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Limk2O54785 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Limk2O54785 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Limk2O54785 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Limk2O54785 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Limk2O54785 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Limk2O54785 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Limk2O54785 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Limk2O54785 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Limk2O54785 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Limk2O54785 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Limk2O54785 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Limk2O54785 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Limk2O54785 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Limk2O54785 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Limk2O54785 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Limk2O54785 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Limk2O54785 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Limk2O54785 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Limk2O54785 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Limk2O54785 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Limk2O54785 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Limk2O54785 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Limk2O54785 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Limk2O54785 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Limk2O54785 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Limk2O54785 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Limk2O54785 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Limk2O54785 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Limk2O54785 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Limk2O54785 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Limk2O54785 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Limk2O54785 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Limk2O54785 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Limk2O54785 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Limk2O54785 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Limk2O54785 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Limk2O54785 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Limk2O54785 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Limk2O54785 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Limk2O54785 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Limk2O54785 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Limk2O54785 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Limk2O54785 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Limk2O54785 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Limk2O54785 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Limk2O54785 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Limk2O54785 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Limk2O54785 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Limk2O54785 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Limk2O54785 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Limk2O54785 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Limk2O54785 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Limk2O54785 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Limk2O54785 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Limk2O54785 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Limk2O54785 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Limk2O54785 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Limk2O54785 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Limk2O54785 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Limk2O54785 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Limk2O54785 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Limk2O54785 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Limk2O54785 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Limk2O54785 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Limk2O54785 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms