Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pik3cdO35904 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pik3cdO35904 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pik3cdO35904 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pik3cdO35904 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pik3cdO35904 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pik3cdO35904 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pik3cdO35904 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pik3cdO35904 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pik3cdO35904 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pik3cdO35904 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pik3cdO35904 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pik3cdO35904 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pik3cdO35904 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pik3cdO35904 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pik3cdO35904 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Pik3cdO35904 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pik3cdO35904 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Pik3cdO35904 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pik3cdO35904 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pik3cdO35904 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pik3cdO35904 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pik3cdO35904 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pik3cdO35904 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pik3cdO35904 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pik3cdO35904 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pik3cdO35904 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pik3cdO35904 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pik3cdO35904 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pik3cdO35904 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pik3cdO35904 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pik3cdO35904 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pik3cdO35904 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pik3cdO35904 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pik3cdO35904 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pik3cdO35904 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pik3cdO35904 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pik3cdO35904 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pik3cdO35904 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Pik3cdO35904 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pik3cdO35904 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pik3cdO35904 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pik3cdO35904 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pik3cdO35904 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pik3cdO35904 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pik3cdO35904 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pik3cdO35904 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pik3cdO35904 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pik3cdO35904 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pik3cdO35904 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pik3cdO35904 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pik3cdO35904 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pik3cdO35904 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Pik3cdO35904 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Pik3cdO35904 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Pik3cdO35904 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pik3cdO35904 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pik3cdO35904 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pik3cdO35904 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pik3cdO35904 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Pik3cdO35904 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pik3cdO35904 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pik3cdO35904 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pik3cdO35904 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pik3cdO35904 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pik3cdO35904 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pik3cdO35904 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Pik3cdO35904 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pik3cdO35904 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pik3cdO35904 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pik3cdO35904 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pik3cdO35904 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pik3cdO35904 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pik3cdO35904 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pik3cdO35904 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pik3cdO35904 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pik3cdO35904 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pik3cdO35904 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pik3cdO35904 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pik3cdO35904 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pik3cdO35904 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pik3cdO35904 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pik3cdO35904 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pik3cdO35904 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pik3cdO35904 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pik3cdO35904 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pik3cdO35904 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pik3cdO35904 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pik3cdO35904 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pik3cdO35904 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pik3cdO35904 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pik3cdO35904 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pik3cdO35904 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Pik3cdO35904 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pik3cdO35904 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pik3cdO35904 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pik3cdO35904 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pik3cdO35904 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pik3cdO35904 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pik3cdO35904 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms