Protein–RNA interactions for Protein: O35448

Ppt2, Lysosomal thioesterase PPT2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppt2O35448 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppt2O35448 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppt2O35448 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppt2O35448 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppt2O35448 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppt2O35448 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppt2O35448 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppt2O35448 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppt2O35448 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppt2O35448 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppt2O35448 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppt2O35448 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppt2O35448 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppt2O35448 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppt2O35448 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppt2O35448 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppt2O35448 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppt2O35448 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppt2O35448 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppt2O35448 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppt2O35448 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppt2O35448 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppt2O35448 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppt2O35448 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppt2O35448 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppt2O35448 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppt2O35448 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppt2O35448 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppt2O35448 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppt2O35448 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppt2O35448 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppt2O35448 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppt2O35448 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppt2O35448 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppt2O35448 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppt2O35448 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppt2O35448 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppt2O35448 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppt2O35448 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppt2O35448 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppt2O35448 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppt2O35448 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppt2O35448 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppt2O35448 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppt2O35448 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppt2O35448 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppt2O35448 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppt2O35448 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppt2O35448 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppt2O35448 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppt2O35448 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppt2O35448 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppt2O35448 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppt2O35448 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppt2O35448 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppt2O35448 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppt2O35448 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppt2O35448 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppt2O35448 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppt2O35448 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppt2O35448 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppt2O35448 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppt2O35448 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppt2O35448 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppt2O35448 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppt2O35448 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppt2O35448 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppt2O35448 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppt2O35448 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppt2O35448 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppt2O35448 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppt2O35448 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppt2O35448 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppt2O35448 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppt2O35448 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppt2O35448 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppt2O35448 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppt2O35448 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ppt2O35448 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppt2O35448 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppt2O35448 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppt2O35448 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppt2O35448 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppt2O35448 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppt2O35448 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppt2O35448 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppt2O35448 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppt2O35448 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppt2O35448 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppt2O35448 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppt2O35448 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppt2O35448 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppt2O35448 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppt2O35448 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppt2O35448 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppt2O35448 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppt2O35448 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppt2O35448 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppt2O35448 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppt2O35448 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 833.2 ms