Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CenpaO35216 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CenpaO35216 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpaO35216 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpaO35216 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpaO35216 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpaO35216 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpaO35216 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpaO35216 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpaO35216 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpaO35216 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpaO35216 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpaO35216 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpaO35216 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpaO35216 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpaO35216 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpaO35216 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpaO35216 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpaO35216 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpaO35216 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpaO35216 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CenpaO35216 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpaO35216 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpaO35216 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpaO35216 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpaO35216 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpaO35216 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpaO35216 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpaO35216 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpaO35216 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpaO35216 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpaO35216 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenpaO35216 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenpaO35216 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenpaO35216 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpaO35216 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpaO35216 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpaO35216 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpaO35216 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpaO35216 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpaO35216 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpaO35216 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpaO35216 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpaO35216 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpaO35216 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpaO35216 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpaO35216 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpaO35216 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpaO35216 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpaO35216 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CenpaO35216 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CenpaO35216 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CenpaO35216 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CenpaO35216 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpaO35216 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpaO35216 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpaO35216 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpaO35216 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpaO35216 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpaO35216 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpaO35216 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CenpaO35216 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpaO35216 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpaO35216 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenpaO35216 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenpaO35216 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenpaO35216 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpaO35216 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpaO35216 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpaO35216 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpaO35216 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpaO35216 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpaO35216 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenpaO35216 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenpaO35216 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenpaO35216 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenpaO35216 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenpaO35216 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpaO35216 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpaO35216 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpaO35216 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpaO35216 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpaO35216 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpaO35216 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpaO35216 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpaO35216 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpaO35216 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpaO35216 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpaO35216 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpaO35216 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpaO35216 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpaO35216 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpaO35216 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpaO35216 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpaO35216 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpaO35216 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpaO35216 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpaO35216 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpaO35216 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpaO35216 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms