Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ArxO35085 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ArxO35085 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ArxO35085 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ArxO35085 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ArxO35085 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ArxO35085 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ArxO35085 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ArxO35085 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ArxO35085 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ArxO35085 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ArxO35085 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ArxO35085 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ArxO35085 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ArxO35085 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ArxO35085 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ArxO35085 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ArxO35085 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ArxO35085 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ArxO35085 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ArxO35085 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ArxO35085 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ArxO35085 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ArxO35085 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ArxO35085 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ArxO35085 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ArxO35085 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ArxO35085 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ArxO35085 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ArxO35085 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ArxO35085 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ArxO35085 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ArxO35085 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ArxO35085 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ArxO35085 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ArxO35085 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ArxO35085 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ArxO35085 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
ArxO35085 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ArxO35085 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ArxO35085 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ArxO35085 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ArxO35085 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ArxO35085 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ArxO35085 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ArxO35085 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ArxO35085 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ArxO35085 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ArxO35085 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ArxO35085 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ArxO35085 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ArxO35085 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ArxO35085 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ArxO35085 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ArxO35085 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ArxO35085 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ArxO35085 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ArxO35085 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ArxO35085 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ArxO35085 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ArxO35085 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ArxO35085 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ArxO35085 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ArxO35085 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ArxO35085 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ArxO35085 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ArxO35085 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ArxO35085 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ArxO35085 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ArxO35085 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ArxO35085 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ArxO35085 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ArxO35085 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ArxO35085 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ArxO35085 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
ArxO35085 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ArxO35085 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
ArxO35085 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ArxO35085 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ArxO35085 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ArxO35085 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ArxO35085 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ArxO35085 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ArxO35085 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ArxO35085 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ArxO35085 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ArxO35085 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ArxO35085 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ArxO35085 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ArxO35085 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ArxO35085 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ArxO35085 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ArxO35085 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ArxO35085 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ArxO35085 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ArxO35085 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
ArxO35085 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ArxO35085 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ArxO35085 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ArxO35085 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms