Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU2

Gm21820, Predicted gene, 21820, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21820J3KMU2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm21820J3KMU2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm21820J3KMU2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm21820J3KMU2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21820J3KMU2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm21820J3KMU2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm21820J3KMU2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm21820J3KMU2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm21820J3KMU2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm21820J3KMU2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm21820J3KMU2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm21820J3KMU2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm21820J3KMU2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm21820J3KMU2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm21820J3KMU2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm21820J3KMU2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm21820J3KMU2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm21820J3KMU2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm21820J3KMU2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm21820J3KMU2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm21820J3KMU2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm21820J3KMU2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm21820J3KMU2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm21820J3KMU2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm21820J3KMU2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm21820J3KMU2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm21820J3KMU2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm21820J3KMU2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm21820J3KMU2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm21820J3KMU2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm21820J3KMU2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm21820J3KMU2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm21820J3KMU2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm21820J3KMU2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm21820J3KMU2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm21820J3KMU2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm21820J3KMU2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm21820J3KMU2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm21820J3KMU2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm21820J3KMU2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm21820J3KMU2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm21820J3KMU2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm21820J3KMU2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm21820J3KMU2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm21820J3KMU2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm21820J3KMU2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm21820J3KMU2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm21820J3KMU2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm21820J3KMU2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21820J3KMU2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm21820J3KMU2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm21820J3KMU2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm21820J3KMU2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm21820J3KMU2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm21820J3KMU2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm21820J3KMU2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm21820J3KMU2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm21820J3KMU2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm21820J3KMU2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm21820J3KMU2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm21820J3KMU2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm21820J3KMU2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm21820J3KMU2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm21820J3KMU2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm21820J3KMU2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm21820J3KMU2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm21820J3KMU2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm21820J3KMU2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm21820J3KMU2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm21820J3KMU2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm21820J3KMU2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm21820J3KMU2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm21820J3KMU2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm21820J3KMU2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm21820J3KMU2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm21820J3KMU2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm21820J3KMU2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm21820J3KMU2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm21820J3KMU2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm21820J3KMU2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm21820J3KMU2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm21820J3KMU2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm21820J3KMU2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm21820J3KMU2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm21820J3KMU2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm21820J3KMU2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm21820J3KMU2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm21820J3KMU2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm21820J3KMU2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm21820J3KMU2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm21820J3KMU2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm21820J3KMU2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm21820J3KMU2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm21820J3KMU2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm21820J3KMU2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm21820J3KMU2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm21820J3KMU2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm21820J3KMU2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm21820J3KMU2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm21820J3KMU2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms