Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hmgxb3G3X9M3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hmgxb3G3X9M3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hmgxb3G3X9M3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hmgxb3G3X9M3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmgxb3G3X9M3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmgxb3G3X9M3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmgxb3G3X9M3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmgxb3G3X9M3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmgxb3G3X9M3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hmgxb3G3X9M3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hmgxb3G3X9M3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmgxb3G3X9M3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmgxb3G3X9M3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmgxb3G3X9M3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmgxb3G3X9M3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmgxb3G3X9M3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmgxb3G3X9M3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmgxb3G3X9M3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmgxb3G3X9M3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmgxb3G3X9M3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmgxb3G3X9M3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmgxb3G3X9M3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hmgxb3G3X9M3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hmgxb3G3X9M3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hmgxb3G3X9M3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hmgxb3G3X9M3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hmgxb3G3X9M3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hmgxb3G3X9M3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hmgxb3G3X9M3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmgxb3G3X9M3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmgxb3G3X9M3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmgxb3G3X9M3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hmgxb3G3X9M3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hmgxb3G3X9M3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmgxb3G3X9M3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hmgxb3G3X9M3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hmgxb3G3X9M3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hmgxb3G3X9M3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmgxb3G3X9M3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmgxb3G3X9M3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmgxb3G3X9M3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmgxb3G3X9M3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmgxb3G3X9M3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmgxb3G3X9M3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmgxb3G3X9M3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmgxb3G3X9M3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmgxb3G3X9M3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmgxb3G3X9M3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmgxb3G3X9M3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmgxb3G3X9M3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmgxb3G3X9M3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmgxb3G3X9M3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmgxb3G3X9M3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmgxb3G3X9M3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Hmgxb3G3X9M3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmgxb3G3X9M3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmgxb3G3X9M3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmgxb3G3X9M3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmgxb3G3X9M3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmgxb3G3X9M3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmgxb3G3X9M3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmgxb3G3X9M3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmgxb3G3X9M3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmgxb3G3X9M3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmgxb3G3X9M3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmgxb3G3X9M3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmgxb3G3X9M3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmgxb3G3X9M3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmgxb3G3X9M3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmgxb3G3X9M3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmgxb3G3X9M3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmgxb3G3X9M3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmgxb3G3X9M3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmgxb3G3X9M3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgxb3G3X9M3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgxb3G3X9M3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmgxb3G3X9M3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgxb3G3X9M3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgxb3G3X9M3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgxb3G3X9M3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmgxb3G3X9M3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgxb3G3X9M3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgxb3G3X9M3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgxb3G3X9M3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgxb3G3X9M3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgxb3G3X9M3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgxb3G3X9M3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmgxb3G3X9M3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hmgxb3G3X9M3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmgxb3G3X9M3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmgxb3G3X9M3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmgxb3G3X9M3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmgxb3G3X9M3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmgxb3G3X9M3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmgxb3G3X9M3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmgxb3G3X9M3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmgxb3G3X9M3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmgxb3G3X9M3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmgxb3G3X9M3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms