Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4cG3UXD1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4cG3UXD1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4cG3UXD1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4cG3UXD1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4cG3UXD1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4cG3UXD1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4cG3UXD1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4cG3UXD1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4cG3UXD1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4cG3UXD1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Speer4cG3UXD1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Speer4cG3UXD1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Speer4cG3UXD1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Speer4cG3UXD1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Speer4cG3UXD1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Speer4cG3UXD1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4cG3UXD1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4cG3UXD1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4cG3UXD1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4cG3UXD1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4cG3UXD1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4cG3UXD1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Speer4cG3UXD1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Speer4cG3UXD1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Speer4cG3UXD1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Speer4cG3UXD1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Speer4cG3UXD1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Speer4cG3UXD1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Speer4cG3UXD1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Speer4cG3UXD1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Speer4cG3UXD1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Speer4cG3UXD1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Speer4cG3UXD1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Speer4cG3UXD1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Speer4cG3UXD1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Speer4cG3UXD1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Speer4cG3UXD1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Speer4cG3UXD1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Speer4cG3UXD1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Speer4cG3UXD1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Speer4cG3UXD1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Speer4cG3UXD1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Speer4cG3UXD1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Speer4cG3UXD1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Speer4cG3UXD1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Speer4cG3UXD1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Speer4cG3UXD1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Speer4cG3UXD1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Speer4cG3UXD1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Speer4cG3UXD1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Speer4cG3UXD1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Speer4cG3UXD1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Speer4cG3UXD1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Speer4cG3UXD1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Speer4cG3UXD1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Speer4cG3UXD1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Speer4cG3UXD1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4cG3UXD1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4cG3UXD1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4cG3UXD1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4cG3UXD1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4cG3UXD1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4cG3UXD1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4cG3UXD1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4cG3UXD1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4cG3UXD1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4cG3UXD1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Speer4cG3UXD1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4cG3UXD1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4cG3UXD1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4cG3UXD1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4cG3UXD1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4cG3UXD1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4cG3UXD1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4cG3UXD1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4cG3UXD1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4cG3UXD1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4cG3UXD1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4cG3UXD1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4cG3UXD1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4cG3UXD1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4cG3UXD1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4cG3UXD1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4cG3UXD1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4cG3UXD1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4cG3UXD1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4cG3UXD1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4cG3UXD1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4cG3UXD1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4cG3UXD1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4cG3UXD1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4cG3UXD1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4cG3UXD1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4cG3UXD1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4cG3UXD1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4cG3UXD1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4cG3UXD1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4cG3UXD1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4cG3UXD1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms