Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20517G3UVU6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20517G3UVU6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20517G3UVU6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20517G3UVU6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20517G3UVU6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20517G3UVU6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20517G3UVU6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20517G3UVU6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20517G3UVU6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20517G3UVU6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20517G3UVU6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20517G3UVU6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20517G3UVU6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20517G3UVU6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20517G3UVU6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20517G3UVU6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20517G3UVU6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20517G3UVU6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20517G3UVU6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20517G3UVU6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20517G3UVU6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20517G3UVU6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20517G3UVU6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20517G3UVU6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20517G3UVU6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20517G3UVU6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20517G3UVU6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20517G3UVU6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20517G3UVU6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20517G3UVU6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20517G3UVU6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20517G3UVU6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20517G3UVU6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20517G3UVU6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20517G3UVU6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20517G3UVU6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20517G3UVU6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20517G3UVU6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20517G3UVU6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20517G3UVU6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20517G3UVU6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20517G3UVU6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20517G3UVU6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20517G3UVU6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20517G3UVU6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20517G3UVU6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20517G3UVU6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20517G3UVU6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20517G3UVU6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20517G3UVU6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20517G3UVU6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20517G3UVU6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20517G3UVU6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20517G3UVU6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20517G3UVU6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20517G3UVU6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20517G3UVU6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20517G3UVU6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20517G3UVU6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20517G3UVU6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20517G3UVU6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20517G3UVU6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20517G3UVU6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20517G3UVU6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20517G3UVU6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20517G3UVU6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20517G3UVU6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20517G3UVU6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20517G3UVU6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20517G3UVU6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20517G3UVU6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm20517G3UVU6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20517G3UVU6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20517G3UVU6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20517G3UVU6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20517G3UVU6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20517G3UVU6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20517G3UVU6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20517G3UVU6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20517G3UVU6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20517G3UVU6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20517G3UVU6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20517G3UVU6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20517G3UVU6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20517G3UVU6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20517G3UVU6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20517G3UVU6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20517G3UVU6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20517G3UVU6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20517G3UVU6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20517G3UVU6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20517G3UVU6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20517G3UVU6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20517G3UVU6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20517G3UVU6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20517G3UVU6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20517G3UVU6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20517G3UVU6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20517G3UVU6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms