Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28038F7BCN9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28038F7BCN9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28038F7BCN9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28038F7BCN9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28038F7BCN9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28038F7BCN9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28038F7BCN9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28038F7BCN9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28038F7BCN9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28038F7BCN9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28038F7BCN9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28038F7BCN9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28038F7BCN9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28038F7BCN9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28038F7BCN9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28038F7BCN9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28038F7BCN9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28038F7BCN9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm28038F7BCN9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm28038F7BCN9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28038F7BCN9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28038F7BCN9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28038F7BCN9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28038F7BCN9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28038F7BCN9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28038F7BCN9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28038F7BCN9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28038F7BCN9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28038F7BCN9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28038F7BCN9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28038F7BCN9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28038F7BCN9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28038F7BCN9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28038F7BCN9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28038F7BCN9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28038F7BCN9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28038F7BCN9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28038F7BCN9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28038F7BCN9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm28038F7BCN9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm28038F7BCN9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28038F7BCN9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28038F7BCN9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm28038F7BCN9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28038F7BCN9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm28038F7BCN9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28038F7BCN9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28038F7BCN9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28038F7BCN9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28038F7BCN9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28038F7BCN9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28038F7BCN9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28038F7BCN9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28038F7BCN9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28038F7BCN9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28038F7BCN9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28038F7BCN9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28038F7BCN9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28038F7BCN9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28038F7BCN9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28038F7BCN9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28038F7BCN9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28038F7BCN9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28038F7BCN9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28038F7BCN9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28038F7BCN9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28038F7BCN9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28038F7BCN9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28038F7BCN9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28038F7BCN9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28038F7BCN9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28038F7BCN9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28038F7BCN9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28038F7BCN9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28038F7BCN9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28038F7BCN9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28038F7BCN9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28038F7BCN9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28038F7BCN9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28038F7BCN9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28038F7BCN9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28038F7BCN9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28038F7BCN9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28038F7BCN9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28038F7BCN9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28038F7BCN9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28038F7BCN9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28038F7BCN9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28038F7BCN9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28038F7BCN9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28038F7BCN9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28038F7BCN9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28038F7BCN9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28038F7BCN9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28038F7BCN9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28038F7BCN9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28038F7BCN9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28038F7BCN9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28038F7BCN9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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