Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm8444F6XS56 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm8444F6XS56 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm8444F6XS56 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm8444F6XS56 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm8444F6XS56 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm8444F6XS56 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm8444F6XS56 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm8444F6XS56 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm8444F6XS56 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm8444F6XS56 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm8444F6XS56 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm8444F6XS56 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm8444F6XS56 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm8444F6XS56 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm8444F6XS56 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm8444F6XS56 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm8444F6XS56 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm8444F6XS56 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm8444F6XS56 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm8444F6XS56 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm8444F6XS56 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm8444F6XS56 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm8444F6XS56 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm8444F6XS56 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm8444F6XS56 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm8444F6XS56 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm8444F6XS56 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm8444F6XS56 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm8444F6XS56 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm8444F6XS56 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm8444F6XS56 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm8444F6XS56 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm8444F6XS56 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm8444F6XS56 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm8444F6XS56 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm8444F6XS56 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm8444F6XS56 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm8444F6XS56 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm8444F6XS56 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm8444F6XS56 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gm8444F6XS56 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm8444F6XS56 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm8444F6XS56 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm8444F6XS56 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm8444F6XS56 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm8444F6XS56 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm8444F6XS56 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm8444F6XS56 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm8444F6XS56 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm8444F6XS56 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm8444F6XS56 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm8444F6XS56 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm8444F6XS56 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm8444F6XS56 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm8444F6XS56 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm8444F6XS56 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm8444F6XS56 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm8444F6XS56 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm8444F6XS56 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm8444F6XS56 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm8444F6XS56 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm8444F6XS56 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm8444F6XS56 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm8444F6XS56 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm8444F6XS56 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm8444F6XS56 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm8444F6XS56 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm8444F6XS56 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm8444F6XS56 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm8444F6XS56 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm8444F6XS56 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm8444F6XS56 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm8444F6XS56 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm8444F6XS56 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm8444F6XS56 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm8444F6XS56 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm8444F6XS56 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm8444F6XS56 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm8444F6XS56 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm8444F6XS56 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm8444F6XS56 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm8444F6XS56 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm8444F6XS56 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm8444F6XS56 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm8444F6XS56 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm8444F6XS56 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm8444F6XS56 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm8444F6XS56 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm8444F6XS56 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm8444F6XS56 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm8444F6XS56 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm8444F6XS56 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm8444F6XS56 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm8444F6XS56 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm8444F6XS56 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm8444F6XS56 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm8444F6XS56 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm8444F6XS56 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm8444F6XS56 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms