Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm17093F6XGJ4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm17093F6XGJ4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm17093F6XGJ4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm17093F6XGJ4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm17093F6XGJ4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm17093F6XGJ4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm17093F6XGJ4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm17093F6XGJ4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm17093F6XGJ4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm17093F6XGJ4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm17093F6XGJ4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm17093F6XGJ4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm17093F6XGJ4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm17093F6XGJ4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm17093F6XGJ4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm17093F6XGJ4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm17093F6XGJ4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm17093F6XGJ4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm17093F6XGJ4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm17093F6XGJ4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm17093F6XGJ4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm17093F6XGJ4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm17093F6XGJ4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm17093F6XGJ4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm17093F6XGJ4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm17093F6XGJ4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm17093F6XGJ4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm17093F6XGJ4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm17093F6XGJ4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm17093F6XGJ4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm17093F6XGJ4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm17093F6XGJ4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm17093F6XGJ4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm17093F6XGJ4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm17093F6XGJ4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm17093F6XGJ4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm17093F6XGJ4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm17093F6XGJ4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm17093F6XGJ4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm17093F6XGJ4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm17093F6XGJ4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm17093F6XGJ4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm17093F6XGJ4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm17093F6XGJ4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm17093F6XGJ4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm17093F6XGJ4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm17093F6XGJ4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm17093F6XGJ4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm17093F6XGJ4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm17093F6XGJ4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm17093F6XGJ4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm17093F6XGJ4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm17093F6XGJ4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm17093F6XGJ4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm17093F6XGJ4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm17093F6XGJ4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm17093F6XGJ4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm17093F6XGJ4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm17093F6XGJ4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm17093F6XGJ4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm17093F6XGJ4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm17093F6XGJ4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm17093F6XGJ4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm17093F6XGJ4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm17093F6XGJ4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm17093F6XGJ4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm17093F6XGJ4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm17093F6XGJ4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm17093F6XGJ4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm17093F6XGJ4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm17093F6XGJ4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm17093F6XGJ4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm17093F6XGJ4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm17093F6XGJ4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm17093F6XGJ4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm17093F6XGJ4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm17093F6XGJ4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm17093F6XGJ4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm17093F6XGJ4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm17093F6XGJ4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm17093F6XGJ4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm17093F6XGJ4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm17093F6XGJ4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm17093F6XGJ4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm17093F6XGJ4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm17093F6XGJ4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm17093F6XGJ4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm17093F6XGJ4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm17093F6XGJ4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm17093F6XGJ4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm17093F6XGJ4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm17093F6XGJ4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm17093F6XGJ4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm17093F6XGJ4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm17093F6XGJ4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm17093F6XGJ4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm17093F6XGJ4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm17093F6XGJ4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm17093F6XGJ4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms