Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5407E9Q7Q1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5407E9Q7Q1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5407E9Q7Q1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5407E9Q7Q1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5407E9Q7Q1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5407E9Q7Q1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5407E9Q7Q1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5407E9Q7Q1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5407E9Q7Q1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5407E9Q7Q1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5407E9Q7Q1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5407E9Q7Q1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5407E9Q7Q1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5407E9Q7Q1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5407E9Q7Q1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5407E9Q7Q1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5407E9Q7Q1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5407E9Q7Q1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5407E9Q7Q1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5407E9Q7Q1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5407E9Q7Q1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5407E9Q7Q1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5407E9Q7Q1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5407E9Q7Q1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5407E9Q7Q1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5407E9Q7Q1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5407E9Q7Q1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5407E9Q7Q1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5407E9Q7Q1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5407E9Q7Q1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5407E9Q7Q1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm5407E9Q7Q1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5407E9Q7Q1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5407E9Q7Q1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5407E9Q7Q1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5407E9Q7Q1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5407E9Q7Q1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5407E9Q7Q1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5407E9Q7Q1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5407E9Q7Q1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5407E9Q7Q1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5407E9Q7Q1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5407E9Q7Q1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5407E9Q7Q1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5407E9Q7Q1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5407E9Q7Q1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5407E9Q7Q1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5407E9Q7Q1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5407E9Q7Q1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5407E9Q7Q1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5407E9Q7Q1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5407E9Q7Q1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5407E9Q7Q1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5407E9Q7Q1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5407E9Q7Q1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5407E9Q7Q1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5407E9Q7Q1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5407E9Q7Q1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5407E9Q7Q1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5407E9Q7Q1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5407E9Q7Q1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5407E9Q7Q1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5407E9Q7Q1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5407E9Q7Q1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5407E9Q7Q1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5407E9Q7Q1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5407E9Q7Q1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5407E9Q7Q1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5407E9Q7Q1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5407E9Q7Q1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5407E9Q7Q1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5407E9Q7Q1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5407E9Q7Q1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5407E9Q7Q1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5407E9Q7Q1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5407E9Q7Q1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5407E9Q7Q1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5407E9Q7Q1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5407E9Q7Q1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5407E9Q7Q1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5407E9Q7Q1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5407E9Q7Q1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5407E9Q7Q1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5407E9Q7Q1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5407E9Q7Q1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5407E9Q7Q1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5407E9Q7Q1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5407E9Q7Q1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5407E9Q7Q1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5407E9Q7Q1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5407E9Q7Q1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5407E9Q7Q1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5407E9Q7Q1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5407E9Q7Q1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5407E9Q7Q1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5407E9Q7Q1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5407E9Q7Q1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5407E9Q7Q1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5407E9Q7Q1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms