Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3020E9Q3J7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3020E9Q3J7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3020E9Q3J7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3020E9Q3J7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3020E9Q3J7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm3020E9Q3J7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3020E9Q3J7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3020E9Q3J7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3020E9Q3J7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3020E9Q3J7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3020E9Q3J7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm3020E9Q3J7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm3020E9Q3J7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm3020E9Q3J7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm3020E9Q3J7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3020E9Q3J7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3020E9Q3J7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3020E9Q3J7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm3020E9Q3J7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm3020E9Q3J7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm3020E9Q3J7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3020E9Q3J7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3020E9Q3J7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3020E9Q3J7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3020E9Q3J7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3020E9Q3J7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3020E9Q3J7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3020E9Q3J7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm3020E9Q3J7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm3020E9Q3J7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3020E9Q3J7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3020E9Q3J7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3020E9Q3J7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Gm3020E9Q3J7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm3020E9Q3J7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm3020E9Q3J7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm3020E9Q3J7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm3020E9Q3J7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm3020E9Q3J7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm3020E9Q3J7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm3020E9Q3J7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3020E9Q3J7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3020E9Q3J7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3020E9Q3J7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3020E9Q3J7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3020E9Q3J7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3020E9Q3J7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3020E9Q3J7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3020E9Q3J7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3020E9Q3J7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3020E9Q3J7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3020E9Q3J7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm3020E9Q3J7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3020E9Q3J7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3020E9Q3J7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3020E9Q3J7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3020E9Q3J7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3020E9Q3J7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3020E9Q3J7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3020E9Q3J7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3020E9Q3J7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3020E9Q3J7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3020E9Q3J7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3020E9Q3J7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3020E9Q3J7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3020E9Q3J7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3020E9Q3J7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3020E9Q3J7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3020E9Q3J7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm3020E9Q3J7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3020E9Q3J7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3020E9Q3J7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3020E9Q3J7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3020E9Q3J7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3020E9Q3J7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3020E9Q3J7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3020E9Q3J7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3020E9Q3J7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3020E9Q3J7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3020E9Q3J7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3020E9Q3J7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3020E9Q3J7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3020E9Q3J7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3020E9Q3J7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3020E9Q3J7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3020E9Q3J7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3020E9Q3J7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3020E9Q3J7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3020E9Q3J7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3020E9Q3J7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3020E9Q3J7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3020E9Q3J7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3020E9Q3J7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3020E9Q3J7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3020E9Q3J7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3020E9Q3J7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3020E9Q3J7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3020E9Q3J7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3020E9Q3J7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3020E9Q3J7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms