Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ccdc171E9Q1U1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ccdc171E9Q1U1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ccdc171E9Q1U1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ccdc171E9Q1U1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccdc171E9Q1U1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ccdc171E9Q1U1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ccdc171E9Q1U1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Ccdc171E9Q1U1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ccdc171E9Q1U1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Ccdc171E9Q1U1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ccdc171E9Q1U1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ccdc171E9Q1U1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ccdc171E9Q1U1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccdc171E9Q1U1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ccdc171E9Q1U1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ccdc171E9Q1U1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ccdc171E9Q1U1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ccdc171E9Q1U1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ccdc171E9Q1U1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ccdc171E9Q1U1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ccdc171E9Q1U1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ccdc171E9Q1U1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ccdc171E9Q1U1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ccdc171E9Q1U1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ccdc171E9Q1U1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ccdc171E9Q1U1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ccdc171E9Q1U1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ccdc171E9Q1U1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ccdc171E9Q1U1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ccdc171E9Q1U1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ccdc171E9Q1U1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Ccdc171E9Q1U1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ccdc171E9Q1U1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccdc171E9Q1U1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccdc171E9Q1U1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccdc171E9Q1U1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccdc171E9Q1U1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccdc171E9Q1U1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ccdc171E9Q1U1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ccdc171E9Q1U1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ccdc171E9Q1U1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ccdc171E9Q1U1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Ccdc171E9Q1U1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccdc171E9Q1U1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccdc171E9Q1U1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccdc171E9Q1U1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccdc171E9Q1U1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccdc171E9Q1U1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Ccdc171E9Q1U1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Ccdc171E9Q1U1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccdc171E9Q1U1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccdc171E9Q1U1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ccdc171E9Q1U1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccdc171E9Q1U1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ccdc171E9Q1U1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ccdc171E9Q1U1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccdc171E9Q1U1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccdc171E9Q1U1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Ccdc171E9Q1U1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Ccdc171E9Q1U1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ccdc171E9Q1U1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ccdc171E9Q1U1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccdc171E9Q1U1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccdc171E9Q1U1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ccdc171E9Q1U1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc171E9Q1U1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ccdc171E9Q1U1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ccdc171E9Q1U1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Ccdc171E9Q1U1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Ccdc171E9Q1U1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ccdc171E9Q1U1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ccdc171E9Q1U1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ccdc171E9Q1U1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ccdc171E9Q1U1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ccdc171E9Q1U1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ccdc171E9Q1U1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccdc171E9Q1U1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ccdc171E9Q1U1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ccdc171E9Q1U1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ccdc171E9Q1U1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Ccdc171E9Q1U1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ccdc171E9Q1U1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ccdc171E9Q1U1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ccdc171E9Q1U1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ccdc171E9Q1U1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ccdc171E9Q1U1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ccdc171E9Q1U1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ccdc171E9Q1U1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ccdc171E9Q1U1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ccdc171E9Q1U1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ccdc171E9Q1U1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
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