Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38,48■■■■□ 3,75
Fndc1E9Q043 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,47■■■■□ 3,75
Fndc1E9Q043 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,45■■■■□ 3,75
Fndc1E9Q043 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC38,45■■■■□ 3,75
Fndc1E9Q043 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC38,43■■■■□ 3,74
Fndc1E9Q043 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,43■■■■□ 3,74
Fndc1E9Q043 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC38,43■■■■□ 3,74
Fndc1E9Q043 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,43■■■■□ 3,74
Fndc1E9Q043 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,42■■■■□ 3,74
Fndc1E9Q043 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,41■■■■□ 3,74
Fndc1E9Q043 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,4■■■■□ 3,74
Fndc1E9Q043 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC38,39■■■■□ 3,74
Fndc1E9Q043 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,37■■■■□ 3,73
Fndc1E9Q043 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,35■■■■□ 3,73
Fndc1E9Q043 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC38,35■■■■□ 3,73
Fndc1E9Q043 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC38,35■■■■□ 3,73
Fndc1E9Q043 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC38,34■■■■□ 3,73
Fndc1E9Q043 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,33■■■■□ 3,73
Fndc1E9Q043 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,32■■■■□ 3,72
Fndc1E9Q043 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC38,31■■■■□ 3,72
Fndc1E9Q043 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,3■■■■□ 3,72
Fndc1E9Q043 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,29■■■■□ 3,72
Fndc1E9Q043 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC38,27■■■■□ 3,72
Fndc1E9Q043 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC38,26■■■■□ 3,72
Fndc1E9Q043 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,25■■■■□ 3,71
Fndc1E9Q043 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC38,24■■■■□ 3,71
Fndc1E9Q043 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC38,24■■■■□ 3,71
Fndc1E9Q043 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC38,19■■■■□ 3,7
Fndc1E9Q043 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC38,18■■■■□ 3,7
Fndc1E9Q043 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC38,18■■■■□ 3,7
Fndc1E9Q043 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38,18■■■■□ 3,7
Fndc1E9Q043 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38,17■■■■□ 3,7
Fndc1E9Q043 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC38,15■■■■□ 3,7
Fndc1E9Q043 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,14■■■■□ 3,7
Fndc1E9Q043 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38,12■■■■□ 3,69
Fndc1E9Q043 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,12■■■■□ 3,69
Fndc1E9Q043 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC38,12■■■■□ 3,69
Fndc1E9Q043 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,12■■■■□ 3,69
Fndc1E9Q043 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,09■■■■□ 3,69
Fndc1E9Q043 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC38,07■■■■□ 3,69
Fndc1E9Q043 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,07■■■■□ 3,69
Fndc1E9Q043 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38,07■■■■□ 3,69
Fndc1E9Q043 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC38,05■■■■□ 3,68
Fndc1E9Q043 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38,05■■■■□ 3,68
Fndc1E9Q043 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC38,05■■■■□ 3,68
Fndc1E9Q043 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,04■■■■□ 3,68
Fndc1E9Q043 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,04■■■■□ 3,68
Fndc1E9Q043 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC38,04■■■■□ 3,68
Fndc1E9Q043 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,03■■■■□ 3,68
Fndc1E9Q043 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3,67
Fndc1E9Q043 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,98■■■■□ 3,67
Fndc1E9Q043 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,98■■■■□ 3,67
Fndc1E9Q043 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,97■■■■□ 3,67
Fndc1E9Q043 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37,97■■■■□ 3,67
Fndc1E9Q043 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC37,97■■■■□ 3,67
Fndc1E9Q043 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37,96■■■■□ 3,67
Fndc1E9Q043 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,95■■■■□ 3,67
Fndc1E9Q043 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,94■■■■□ 3,66
Fndc1E9Q043 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC37,94■■■■□ 3,66
Fndc1E9Q043 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC37,92■■■■□ 3,66
Fndc1E9Q043 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC37,92■■■■□ 3,66
Fndc1E9Q043 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC37,91■■■■□ 3,66
Fndc1E9Q043 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,91■■■■□ 3,66
Fndc1E9Q043 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC37,91■■■■□ 3,66
Fndc1E9Q043 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC37,9■■■■□ 3,66
Fndc1E9Q043 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,9■■■■□ 3,66
Fndc1E9Q043 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,9■■■■□ 3,66
Fndc1E9Q043 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC37,89■■■■□ 3,66
Fndc1E9Q043 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC37,88■■■■□ 3,65
Fndc1E9Q043 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37,88■■■■□ 3,65
Fndc1E9Q043 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC37,87■■■■□ 3,65
Fndc1E9Q043 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,87■■■■□ 3,65
Fndc1E9Q043 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC37,87■■■■□ 3,65
Fndc1E9Q043 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,87■■■■□ 3,65
Fndc1E9Q043 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,87■■■■□ 3,65
Fndc1E9Q043 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC37,86■■■■□ 3,65
Fndc1E9Q043 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC37,85■■■■□ 3,65
Fndc1E9Q043 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,84■■■■□ 3,65
Fndc1E9Q043 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC37,84■■■■□ 3,65
Fndc1E9Q043 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,82■■■■□ 3,65
Fndc1E9Q043 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,8■■■■□ 3,64
Fndc1E9Q043 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,79■■■■□ 3,64
Fndc1E9Q043 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,79■■■■□ 3,64
Fndc1E9Q043 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,79■■■■□ 3,64
Fndc1E9Q043 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC37,78■■■■□ 3,64
Fndc1E9Q043 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC37,78■■■■□ 3,64
Fndc1E9Q043 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC37,78■■■■□ 3,64
Fndc1E9Q043 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,78■■■■□ 3,64
Fndc1E9Q043 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC37,77■■■■□ 3,64
Fndc1E9Q043 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC37,76■■■■□ 3,64
Fndc1E9Q043 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,76■■■■□ 3,64
Fndc1E9Q043 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,76■■■■□ 3,63
Fndc1E9Q043 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,75■■■■□ 3,63
Fndc1E9Q043 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC37,74■■■■□ 3,63
Fndc1E9Q043 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC37,74■■■■□ 3,63
Fndc1E9Q043 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC37,73■■■■□ 3,63
Fndc1E9Q043 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC37,73■■■■□ 3,63
Fndc1E9Q043 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,73■■■■□ 3,63
Fndc1E9Q043 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,73■■■■□ 3,63
Fndc1E9Q043 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,72■■■■□ 3,63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,6 ms