Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC2

Gm28043, E3 ubiquitin-protein ligase RNF8, mousemouse

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28043E0CXC2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm28043E0CXC2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28043E0CXC2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm28043E0CXC2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm28043E0CXC2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm28043E0CXC2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm28043E0CXC2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm28043E0CXC2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm28043E0CXC2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm28043E0CXC2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm28043E0CXC2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28043E0CXC2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28043E0CXC2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm28043E0CXC2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm28043E0CXC2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm28043E0CXC2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm28043E0CXC2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm28043E0CXC2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm28043E0CXC2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm28043E0CXC2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm28043E0CXC2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm28043E0CXC2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm28043E0CXC2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm28043E0CXC2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm28043E0CXC2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm28043E0CXC2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm28043E0CXC2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm28043E0CXC2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm28043E0CXC2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm28043E0CXC2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm28043E0CXC2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm28043E0CXC2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm28043E0CXC2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm28043E0CXC2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm28043E0CXC2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm28043E0CXC2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm28043E0CXC2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm28043E0CXC2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm28043E0CXC2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm28043E0CXC2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm28043E0CXC2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm28043E0CXC2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm28043E0CXC2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm28043E0CXC2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm28043E0CXC2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm28043E0CXC2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm28043E0CXC2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm28043E0CXC2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm28043E0CXC2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm28043E0CXC2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm28043E0CXC2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm28043E0CXC2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm28043E0CXC2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm28043E0CXC2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm28043E0CXC2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm28043E0CXC2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm28043E0CXC2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm28043E0CXC2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm28043E0CXC2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm28043E0CXC2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm28043E0CXC2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm28043E0CXC2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm28043E0CXC2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm28043E0CXC2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm28043E0CXC2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm28043E0CXC2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm28043E0CXC2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm28043E0CXC2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm28043E0CXC2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm28043E0CXC2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm28043E0CXC2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm28043E0CXC2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm28043E0CXC2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm28043E0CXC2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm28043E0CXC2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm28043E0CXC2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm28043E0CXC2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm28043E0CXC2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm28043E0CXC2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm28043E0CXC2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm28043E0CXC2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm28043E0CXC2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm28043E0CXC2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm28043E0CXC2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm28043E0CXC2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm28043E0CXC2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm28043E0CXC2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm28043E0CXC2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm28043E0CXC2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm28043E0CXC2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm28043E0CXC2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm28043E0CXC2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm28043E0CXC2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm28043E0CXC2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm28043E0CXC2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm28043E0CXC2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm28043E0CXC2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gm28043E0CXC2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm28043E0CXC2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm28043E0CXC2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms