Protein–RNA interactions for Protein: D3Z7Q2

Smim20, Small integral membrane protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim20D3Z7Q2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim20D3Z7Q2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim20D3Z7Q2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim20D3Z7Q2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim20D3Z7Q2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim20D3Z7Q2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim20D3Z7Q2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim20D3Z7Q2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim20D3Z7Q2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim20D3Z7Q2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim20D3Z7Q2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim20D3Z7Q2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim20D3Z7Q2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim20D3Z7Q2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim20D3Z7Q2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim20D3Z7Q2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim20D3Z7Q2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim20D3Z7Q2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim20D3Z7Q2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim20D3Z7Q2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim20D3Z7Q2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim20D3Z7Q2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim20D3Z7Q2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim20D3Z7Q2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim20D3Z7Q2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim20D3Z7Q2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim20D3Z7Q2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim20D3Z7Q2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim20D3Z7Q2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim20D3Z7Q2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim20D3Z7Q2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim20D3Z7Q2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim20D3Z7Q2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim20D3Z7Q2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim20D3Z7Q2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smim20D3Z7Q2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim20D3Z7Q2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim20D3Z7Q2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim20D3Z7Q2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim20D3Z7Q2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim20D3Z7Q2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim20D3Z7Q2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim20D3Z7Q2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim20D3Z7Q2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim20D3Z7Q2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim20D3Z7Q2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim20D3Z7Q2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim20D3Z7Q2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim20D3Z7Q2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim20D3Z7Q2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim20D3Z7Q2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim20D3Z7Q2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim20D3Z7Q2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim20D3Z7Q2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim20D3Z7Q2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim20D3Z7Q2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim20D3Z7Q2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim20D3Z7Q2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim20D3Z7Q2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim20D3Z7Q2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim20D3Z7Q2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim20D3Z7Q2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim20D3Z7Q2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim20D3Z7Q2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim20D3Z7Q2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim20D3Z7Q2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim20D3Z7Q2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms