Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc170D3YXL0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc170D3YXL0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc170D3YXL0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc170D3YXL0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc170D3YXL0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc170D3YXL0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc170D3YXL0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc170D3YXL0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc170D3YXL0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc170D3YXL0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc170D3YXL0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc170D3YXL0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc170D3YXL0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc170D3YXL0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc170D3YXL0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc170D3YXL0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc170D3YXL0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc170D3YXL0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc170D3YXL0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc170D3YXL0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc170D3YXL0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc170D3YXL0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc170D3YXL0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc170D3YXL0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc170D3YXL0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc170D3YXL0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc170D3YXL0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc170D3YXL0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc170D3YXL0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc170D3YXL0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc170D3YXL0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc170D3YXL0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc170D3YXL0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc170D3YXL0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc170D3YXL0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc170D3YXL0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc170D3YXL0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc170D3YXL0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc170D3YXL0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc170D3YXL0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc170D3YXL0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc170D3YXL0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc170D3YXL0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc170D3YXL0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc170D3YXL0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc170D3YXL0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc170D3YXL0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc170D3YXL0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc170D3YXL0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc170D3YXL0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc170D3YXL0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc170D3YXL0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc170D3YXL0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc170D3YXL0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc170D3YXL0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc170D3YXL0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc170D3YXL0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc170D3YXL0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc170D3YXL0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc170D3YXL0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc170D3YXL0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc170D3YXL0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc170D3YXL0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc170D3YXL0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc170D3YXL0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc170D3YXL0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc170D3YXL0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc170D3YXL0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc170D3YXL0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc170D3YXL0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc170D3YXL0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc170D3YXL0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc170D3YXL0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc170D3YXL0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc170D3YXL0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc170D3YXL0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc170D3YXL0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc170D3YXL0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc170D3YXL0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc170D3YXL0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc170D3YXL0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc170D3YXL0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc170D3YXL0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc170D3YXL0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc170D3YXL0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc170D3YXL0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc170D3YXL0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc170D3YXL0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc170D3YXL0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc170D3YXL0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc170D3YXL0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc170D3YXL0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc170D3YXL0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc170D3YXL0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc170D3YXL0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc170D3YXL0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc170D3YXL0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc170D3YXL0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc170D3YXL0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms