Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim30cD3YVI9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Trim30cD3YVI9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim30cD3YVI9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim30cD3YVI9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim30cD3YVI9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim30cD3YVI9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim30cD3YVI9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim30cD3YVI9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim30cD3YVI9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim30cD3YVI9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim30cD3YVI9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim30cD3YVI9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim30cD3YVI9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim30cD3YVI9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim30cD3YVI9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim30cD3YVI9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim30cD3YVI9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim30cD3YVI9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim30cD3YVI9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim30cD3YVI9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim30cD3YVI9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim30cD3YVI9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim30cD3YVI9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trim30cD3YVI9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trim30cD3YVI9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trim30cD3YVI9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trim30cD3YVI9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim30cD3YVI9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim30cD3YVI9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim30cD3YVI9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim30cD3YVI9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim30cD3YVI9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim30cD3YVI9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim30cD3YVI9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim30cD3YVI9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim30cD3YVI9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim30cD3YVI9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim30cD3YVI9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim30cD3YVI9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim30cD3YVI9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim30cD3YVI9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim30cD3YVI9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim30cD3YVI9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim30cD3YVI9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim30cD3YVI9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim30cD3YVI9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim30cD3YVI9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim30cD3YVI9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim30cD3YVI9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim30cD3YVI9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim30cD3YVI9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim30cD3YVI9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim30cD3YVI9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim30cD3YVI9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim30cD3YVI9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim30cD3YVI9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim30cD3YVI9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim30cD3YVI9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim30cD3YVI9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim30cD3YVI9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim30cD3YVI9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim30cD3YVI9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim30cD3YVI9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim30cD3YVI9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim30cD3YVI9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim30cD3YVI9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim30cD3YVI9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim30cD3YVI9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim30cD3YVI9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim30cD3YVI9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim30cD3YVI9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim30cD3YVI9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim30cD3YVI9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim30cD3YVI9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trim30cD3YVI9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim30cD3YVI9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim30cD3YVI9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim30cD3YVI9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim30cD3YVI9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim30cD3YVI9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim30cD3YVI9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim30cD3YVI9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim30cD3YVI9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim30cD3YVI9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim30cD3YVI9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim30cD3YVI9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim30cD3YVI9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim30cD3YVI9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim30cD3YVI9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim30cD3YVI9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim30cD3YVI9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim30cD3YVI9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim30cD3YVI9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim30cD3YVI9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim30cD3YVI9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim30cD3YVI9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim30cD3YVI9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim30cD3YVI9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim30cD3YVI9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms