Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm20547B8JJN0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm20547B8JJN0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm20547B8JJN0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm20547B8JJN0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm20547B8JJN0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm20547B8JJN0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm20547B8JJN0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm20547B8JJN0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm20547B8JJN0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm20547B8JJN0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm20547B8JJN0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm20547B8JJN0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm20547B8JJN0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm20547B8JJN0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm20547B8JJN0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm20547B8JJN0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm20547B8JJN0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm20547B8JJN0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm20547B8JJN0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm20547B8JJN0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm20547B8JJN0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm20547B8JJN0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm20547B8JJN0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm20547B8JJN0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm20547B8JJN0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm20547B8JJN0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm20547B8JJN0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm20547B8JJN0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm20547B8JJN0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm20547B8JJN0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm20547B8JJN0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm20547B8JJN0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm20547B8JJN0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm20547B8JJN0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm20547B8JJN0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm20547B8JJN0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm20547B8JJN0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm20547B8JJN0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm20547B8JJN0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm20547B8JJN0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm20547B8JJN0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm20547B8JJN0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm20547B8JJN0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm20547B8JJN0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm20547B8JJN0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm20547B8JJN0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm20547B8JJN0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm20547B8JJN0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm20547B8JJN0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm20547B8JJN0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm20547B8JJN0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm20547B8JJN0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm20547B8JJN0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm20547B8JJN0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm20547B8JJN0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm20547B8JJN0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm20547B8JJN0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm20547B8JJN0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm20547B8JJN0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm20547B8JJN0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm20547B8JJN0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm20547B8JJN0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm20547B8JJN0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm20547B8JJN0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm20547B8JJN0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm20547B8JJN0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm20547B8JJN0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm20547B8JJN0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm20547B8JJN0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm20547B8JJN0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm20547B8JJN0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm20547B8JJN0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm20547B8JJN0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm20547B8JJN0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm20547B8JJN0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm20547B8JJN0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm20547B8JJN0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm20547B8JJN0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm20547B8JJN0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm20547B8JJN0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm20547B8JJN0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm20547B8JJN0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm20547B8JJN0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm20547B8JJN0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm20547B8JJN0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm20547B8JJN0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Gm20547B8JJN0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm20547B8JJN0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm20547B8JJN0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm20547B8JJN0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm20547B8JJN0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm20547B8JJN0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm20547B8JJN0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm20547B8JJN0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm20547B8JJN0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm20547B8JJN0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm20547B8JJN0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm20547B8JJN0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm20547B8JJN0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms