Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Spocd1B1ASB6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Spocd1B1ASB6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Spocd1B1ASB6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Spocd1B1ASB6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Spocd1B1ASB6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Spocd1B1ASB6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,66■■■□□ 2,02
Spocd1B1ASB6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27,66■■■□□ 2,02
Spocd1B1ASB6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Spocd1B1ASB6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,65■■■□□ 2,02
Spocd1B1ASB6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Spocd1B1ASB6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Spocd1B1ASB6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,64■■■□□ 2,02
Spocd1B1ASB6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Spocd1B1ASB6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Spocd1B1ASB6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Spocd1B1ASB6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Spocd1B1ASB6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Spocd1B1ASB6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Spocd1B1ASB6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Spocd1B1ASB6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,59■■■□□ 2,01
Spocd1B1ASB6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Spocd1B1ASB6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Spocd1B1ASB6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2
Spocd1B1ASB6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,57■■■□□ 2
Spocd1B1ASB6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Spocd1B1ASB6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Spocd1B1ASB6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Spocd1B1ASB6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Spocd1B1ASB6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Spocd1B1ASB6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Spocd1B1ASB6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27,52■■■□□ 2
Spocd1B1ASB6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27,51■■□□□ 1,99
Spocd1B1ASB6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Spocd1B1ASB6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Spocd1B1ASB6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Spocd1B1ASB6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27,5■■□□□ 1,99
Spocd1B1ASB6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Spocd1B1ASB6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Spocd1B1ASB6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27,49■■□□□ 1,99
Spocd1B1ASB6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Spocd1B1ASB6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Spocd1B1ASB6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27,47■■□□□ 1,99
Spocd1B1ASB6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Spocd1B1ASB6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Spocd1B1ASB6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Spocd1B1ASB6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Spocd1B1ASB6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,99
Spocd1B1ASB6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Spocd1B1ASB6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Spocd1B1ASB6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27,43■■□□□ 1,98
Spocd1B1ASB6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Spocd1B1ASB6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,42■■□□□ 1,98
Spocd1B1ASB6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Spocd1B1ASB6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27,4■■□□□ 1,98
Spocd1B1ASB6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Spocd1B1ASB6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Spocd1B1ASB6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Spocd1B1ASB6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Spocd1B1ASB6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Spocd1B1ASB6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Spocd1B1ASB6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Spocd1B1ASB6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Spocd1B1ASB6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Spocd1B1ASB6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Spocd1B1ASB6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Spocd1B1ASB6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Spocd1B1ASB6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Spocd1B1ASB6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Spocd1B1ASB6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27,33■■□□□ 1,97
Spocd1B1ASB6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Spocd1B1ASB6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Spocd1B1ASB6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27,31■■□□□ 1,96
Spocd1B1ASB6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Spocd1B1ASB6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Spocd1B1ASB6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Spocd1B1ASB6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Spocd1B1ASB6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Spocd1B1ASB6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Spocd1B1ASB6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Spocd1B1ASB6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Spocd1B1ASB6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Spocd1B1ASB6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Spocd1B1ASB6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Spocd1B1ASB6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Spocd1B1ASB6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Spocd1B1ASB6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27,24■■□□□ 1,95
Spocd1B1ASB6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Spocd1B1ASB6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Spocd1B1ASB6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Spocd1B1ASB6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Spocd1B1ASB6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Spocd1B1ASB6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,21■■□□□ 1,95
Spocd1B1ASB6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Spocd1B1ASB6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27,2■■□□□ 1,95
Spocd1B1ASB6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27,2■■□□□ 1,94
Spocd1B1ASB6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Spocd1B1ASB6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Spocd1B1ASB6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27,17■■□□□ 1,94
Spocd1B1ASB6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27,17■■□□□ 1,94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms