Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc9bA3KGF9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc9bA3KGF9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc9bA3KGF9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc9bA3KGF9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc9bA3KGF9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc9bA3KGF9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc9bA3KGF9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc9bA3KGF9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc9bA3KGF9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc9bA3KGF9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc9bA3KGF9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc9bA3KGF9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc9bA3KGF9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc9bA3KGF9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc9bA3KGF9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc9bA3KGF9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc9bA3KGF9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc9bA3KGF9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc9bA3KGF9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc9bA3KGF9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc9bA3KGF9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc9bA3KGF9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc9bA3KGF9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc9bA3KGF9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc9bA3KGF9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc9bA3KGF9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc9bA3KGF9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc9bA3KGF9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc9bA3KGF9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc9bA3KGF9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc9bA3KGF9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc9bA3KGF9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc9bA3KGF9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc9bA3KGF9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc9bA3KGF9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc9bA3KGF9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc9bA3KGF9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc9bA3KGF9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc9bA3KGF9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc9bA3KGF9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc9bA3KGF9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc9bA3KGF9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc9bA3KGF9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc9bA3KGF9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc9bA3KGF9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc9bA3KGF9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc9bA3KGF9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc9bA3KGF9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc9bA3KGF9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc9bA3KGF9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc9bA3KGF9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc9bA3KGF9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc9bA3KGF9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc9bA3KGF9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc9bA3KGF9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc9bA3KGF9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc9bA3KGF9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc9bA3KGF9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc9bA3KGF9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc9bA3KGF9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc9bA3KGF9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc9bA3KGF9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc9bA3KGF9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc9bA3KGF9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc9bA3KGF9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc9bA3KGF9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc9bA3KGF9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc9bA3KGF9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc9bA3KGF9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc9bA3KGF9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc9bA3KGF9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc9bA3KGF9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc9bA3KGF9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc9bA3KGF9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc9bA3KGF9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc9bA3KGF9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc9bA3KGF9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc9bA3KGF9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc9bA3KGF9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc9bA3KGF9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc9bA3KGF9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc9bA3KGF9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc9bA3KGF9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc9bA3KGF9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc9bA3KGF9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc9bA3KGF9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc9bA3KGF9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc9bA3KGF9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc9bA3KGF9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc9bA3KGF9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc9bA3KGF9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc9bA3KGF9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc9bA3KGF9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc9bA3KGF9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc9bA3KGF9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc9bA3KGF9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc9bA3KGF9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc9bA3KGF9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc9bA3KGF9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms