Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Htra4A2RT60 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Htra4A2RT60 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Htra4A2RT60 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Htra4A2RT60 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Htra4A2RT60 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Htra4A2RT60 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Htra4A2RT60 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Htra4A2RT60 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Htra4A2RT60 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Htra4A2RT60 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Htra4A2RT60 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Htra4A2RT60 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Htra4A2RT60 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Htra4A2RT60 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Htra4A2RT60 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Htra4A2RT60 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Htra4A2RT60 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Htra4A2RT60 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Htra4A2RT60 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Htra4A2RT60 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Htra4A2RT60 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Htra4A2RT60 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Htra4A2RT60 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Htra4A2RT60 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Htra4A2RT60 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Htra4A2RT60 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Htra4A2RT60 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Htra4A2RT60 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Htra4A2RT60 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Htra4A2RT60 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Htra4A2RT60 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Htra4A2RT60 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Htra4A2RT60 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Htra4A2RT60 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Htra4A2RT60 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Htra4A2RT60 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Htra4A2RT60 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Htra4A2RT60 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Htra4A2RT60 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Htra4A2RT60 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Htra4A2RT60 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Htra4A2RT60 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Htra4A2RT60 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Htra4A2RT60 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Htra4A2RT60 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Htra4A2RT60 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Htra4A2RT60 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Htra4A2RT60 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Htra4A2RT60 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Htra4A2RT60 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Htra4A2RT60 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Htra4A2RT60 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Htra4A2RT60 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Htra4A2RT60 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Htra4A2RT60 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Htra4A2RT60 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Htra4A2RT60 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Htra4A2RT60 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Htra4A2RT60 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Htra4A2RT60 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htra4A2RT60 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htra4A2RT60 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htra4A2RT60 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htra4A2RT60 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Htra4A2RT60 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Htra4A2RT60 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Htra4A2RT60 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Htra4A2RT60 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Htra4A2RT60 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Htra4A2RT60 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Htra4A2RT60 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Htra4A2RT60 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Htra4A2RT60 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Htra4A2RT60 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Htra4A2RT60 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Htra4A2RT60 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Htra4A2RT60 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Htra4A2RT60 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Htra4A2RT60 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Htra4A2RT60 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Htra4A2RT60 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htra4A2RT60 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htra4A2RT60 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htra4A2RT60 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htra4A2RT60 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htra4A2RT60 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htra4A2RT60 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Htra4A2RT60 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htra4A2RT60 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htra4A2RT60 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htra4A2RT60 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htra4A2RT60 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Htra4A2RT60 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Htra4A2RT60 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Htra4A2RT60 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Htra4A2RT60 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Htra4A2RT60 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Htra4A2RT60 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Htra4A2RT60 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms