Protein–RNA interactions for Protein: A2A6V5

E030025P04Rik, RIKEN cDNA E030025P04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030025P04RikA2A6V5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E030025P04RikA2A6V5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E030025P04RikA2A6V5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E030025P04RikA2A6V5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E030025P04RikA2A6V5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E030025P04RikA2A6V5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E030025P04RikA2A6V5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E030025P04RikA2A6V5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
E030025P04RikA2A6V5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
E030025P04RikA2A6V5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E030025P04RikA2A6V5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E030025P04RikA2A6V5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E030025P04RikA2A6V5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E030025P04RikA2A6V5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
E030025P04RikA2A6V5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E030025P04RikA2A6V5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E030025P04RikA2A6V5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E030025P04RikA2A6V5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E030025P04RikA2A6V5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E030025P04RikA2A6V5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E030025P04RikA2A6V5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E030025P04RikA2A6V5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
E030025P04RikA2A6V5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E030025P04RikA2A6V5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E030025P04RikA2A6V5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E030025P04RikA2A6V5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E030025P04RikA2A6V5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E030025P04RikA2A6V5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E030025P04RikA2A6V5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
E030025P04RikA2A6V5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E030025P04RikA2A6V5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E030025P04RikA2A6V5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E030025P04RikA2A6V5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E030025P04RikA2A6V5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E030025P04RikA2A6V5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
E030025P04RikA2A6V5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E030025P04RikA2A6V5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E030025P04RikA2A6V5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E030025P04RikA2A6V5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E030025P04RikA2A6V5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E030025P04RikA2A6V5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E030025P04RikA2A6V5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E030025P04RikA2A6V5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E030025P04RikA2A6V5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E030025P04RikA2A6V5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
E030025P04RikA2A6V5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E030025P04RikA2A6V5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E030025P04RikA2A6V5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E030025P04RikA2A6V5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E030025P04RikA2A6V5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E030025P04RikA2A6V5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E030025P04RikA2A6V5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
E030025P04RikA2A6V5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
E030025P04RikA2A6V5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
E030025P04RikA2A6V5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E030025P04RikA2A6V5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E030025P04RikA2A6V5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E030025P04RikA2A6V5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
E030025P04RikA2A6V5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E030025P04RikA2A6V5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E030025P04RikA2A6V5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E030025P04RikA2A6V5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E030025P04RikA2A6V5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E030025P04RikA2A6V5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E030025P04RikA2A6V5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E030025P04RikA2A6V5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E030025P04RikA2A6V5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E030025P04RikA2A6V5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
E030025P04RikA2A6V5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
E030025P04RikA2A6V5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E030025P04RikA2A6V5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E030025P04RikA2A6V5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E030025P04RikA2A6V5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E030025P04RikA2A6V5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E030025P04RikA2A6V5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E030025P04RikA2A6V5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22■■□□□ 1.11
E030025P04RikA2A6V5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E030025P04RikA2A6V5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E030025P04RikA2A6V5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E030025P04RikA2A6V5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E030025P04RikA2A6V5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E030025P04RikA2A6V5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E030025P04RikA2A6V5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E030025P04RikA2A6V5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E030025P04RikA2A6V5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
E030025P04RikA2A6V5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E030025P04RikA2A6V5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E030025P04RikA2A6V5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E030025P04RikA2A6V5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E030025P04RikA2A6V5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E030025P04RikA2A6V5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E030025P04RikA2A6V5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E030025P04RikA2A6V5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E030025P04RikA2A6V5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E030025P04RikA2A6V5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E030025P04RikA2A6V5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E030025P04RikA2A6V5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E030025P04RikA2A6V5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
E030025P04RikA2A6V5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E030025P04RikA2A6V5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms