Protein–RNA interactions for Protein: A2A588

Krtap1-3, Keratin-associated protein 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-3A2A588 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krtap1-3A2A588 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krtap1-3A2A588 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krtap1-3A2A588 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krtap1-3A2A588 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krtap1-3A2A588 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krtap1-3A2A588 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krtap1-3A2A588 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krtap1-3A2A588 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krtap1-3A2A588 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krtap1-3A2A588 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krtap1-3A2A588 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krtap1-3A2A588 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krtap1-3A2A588 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krtap1-3A2A588 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krtap1-3A2A588 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krtap1-3A2A588 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krtap1-3A2A588 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krtap1-3A2A588 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krtap1-3A2A588 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krtap1-3A2A588 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krtap1-3A2A588 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krtap1-3A2A588 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krtap1-3A2A588 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krtap1-3A2A588 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krtap1-3A2A588 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krtap1-3A2A588 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krtap1-3A2A588 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krtap1-3A2A588 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krtap1-3A2A588 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krtap1-3A2A588 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krtap1-3A2A588 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krtap1-3A2A588 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krtap1-3A2A588 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krtap1-3A2A588 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krtap1-3A2A588 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krtap1-3A2A588 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krtap1-3A2A588 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krtap1-3A2A588 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Krtap1-3A2A588 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Krtap1-3A2A588 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krtap1-3A2A588 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krtap1-3A2A588 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krtap1-3A2A588 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krtap1-3A2A588 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Krtap1-3A2A588 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krtap1-3A2A588 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krtap1-3A2A588 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krtap1-3A2A588 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krtap1-3A2A588 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Krtap1-3A2A588 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Krtap1-3A2A588 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Krtap1-3A2A588 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Krtap1-3A2A588 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Krtap1-3A2A588 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Krtap1-3A2A588 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krtap1-3A2A588 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krtap1-3A2A588 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krtap1-3A2A588 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krtap1-3A2A588 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krtap1-3A2A588 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krtap1-3A2A588 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krtap1-3A2A588 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krtap1-3A2A588 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krtap1-3A2A588 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krtap1-3A2A588 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.3 ms