Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trav12-2A0N8N6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trav12-2A0N8N6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trav12-2A0N8N6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trav12-2A0N8N6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trav12-2A0N8N6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trav12-2A0N8N6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trav12-2A0N8N6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trav12-2A0N8N6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trav12-2A0N8N6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trav12-2A0N8N6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trav12-2A0N8N6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trav12-2A0N8N6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trav12-2A0N8N6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trav12-2A0N8N6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trav12-2A0N8N6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trav12-2A0N8N6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trav12-2A0N8N6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trav12-2A0N8N6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trav12-2A0N8N6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trav12-2A0N8N6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trav12-2A0N8N6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trav12-2A0N8N6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trav12-2A0N8N6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trav12-2A0N8N6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trav12-2A0N8N6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trav12-2A0N8N6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trav12-2A0N8N6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trav12-2A0N8N6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trav12-2A0N8N6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trav12-2A0N8N6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trav12-2A0N8N6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trav12-2A0N8N6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trav12-2A0N8N6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trav12-2A0N8N6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trav12-2A0N8N6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trav12-2A0N8N6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trav12-2A0N8N6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trav12-2A0N8N6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trav12-2A0N8N6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trav12-2A0N8N6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trav12-2A0N8N6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trav12-2A0N8N6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trav12-2A0N8N6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trav12-2A0N8N6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trav12-2A0N8N6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trav12-2A0N8N6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trav12-2A0N8N6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trav12-2A0N8N6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trav12-2A0N8N6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trav12-2A0N8N6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trav12-2A0N8N6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trav12-2A0N8N6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trav12-2A0N8N6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trav12-2A0N8N6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trav12-2A0N8N6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trav12-2A0N8N6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trav12-2A0N8N6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trav12-2A0N8N6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trav12-2A0N8N6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trav12-2A0N8N6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trav12-2A0N8N6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trav12-2A0N8N6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trav12-2A0N8N6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trav12-2A0N8N6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trav12-2A0N8N6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trav12-2A0N8N6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trav12-2A0N8N6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trav12-2A0N8N6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trav12-2A0N8N6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trav12-2A0N8N6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trav12-2A0N8N6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trav12-2A0N8N6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trav12-2A0N8N6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trav12-2A0N8N6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trav12-2A0N8N6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trav12-2A0N8N6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trav12-2A0N8N6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trav12-2A0N8N6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trav12-2A0N8N6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trav12-2A0N8N6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trav12-2A0N8N6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trav12-2A0N8N6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trav12-2A0N8N6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trav12-2A0N8N6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trav12-2A0N8N6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trav12-2A0N8N6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trav12-2A0N8N6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trav12-2A0N8N6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trav12-2A0N8N6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trav12-2A0N8N6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trav12-2A0N8N6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trav12-2A0N8N6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trav12-2A0N8N6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trav12-2A0N8N6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trav12-2A0N8N6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trav12-2A0N8N6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trav12-2A0N8N6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trav12-2A0N8N6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trav12-2A0N8N6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms