Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Arpp21-203ENSMUST00000111872 3316 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Arpp21-229ENSMUST00000164754 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Ctps2-201ENSMUST00000033727 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 6030443J06Rik-203ENSMUST00000181764 4299 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Adgrd1-203ENSMUST00000156437 4141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Olfr523-204ENSMUST00000214272 3780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Luzp4-202ENSMUST00000163338 2025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Vmn1r176-202ENSMUST00000226319 2930 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Zfp979-202ENSMUST00000105720 2594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Sept3-201ENSMUST00000023095 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Gm4451-201ENSMUST00000186000 1891 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Map1a-202ENSMUST00000110639 10145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Sulf1-205ENSMUST00000186051 4563 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Cnot2-204ENSMUST00000164088 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Nutm1-201ENSMUST00000043970 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Ablim1-207ENSMUST00000111529 5927 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Igf1r-201ENSMUST00000005671 11409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 3110099E03Rik-203ENSMUST00000143695 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Ces3a-202ENSMUST00000093223 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Slc5a4b-201ENSMUST00000120757 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Gng7-204ENSMUST00000118233 3433 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Ube3bQ9ES34 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Zfp472-201ENSMUST00000039132 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Cherp-201ENSMUST00000079510 3713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Gm43890-201ENSMUST00000203437 2799 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Olfr943-204ENSMUST00000213830 8305 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Mcm7-201ENSMUST00000000505 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Fam107a-201ENSMUST00000036070 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Tsacc-201ENSMUST00000010682 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Gm12851-201ENSMUST00000117920 421 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Gm10651-201ENSMUST00000118212 609 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Gm12773-201ENSMUST00000120134 587 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
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Ube3bQ9ES34 Gm12692-201ENSMUST00000121092 546 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
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Ube3bQ9ES34 4930483K19Rik-201ENSMUST00000127576 1237 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Ube3bQ9ES34 Uqcrb-201ENSMUST00000021993 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Ube3bQ9ES34 Serpina1a-201ENSMUST00000072876 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Eif4e2-207ENSMUST00000113235 3473 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Hmgcs1-202ENSMUST00000224188 3464 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Fam217a-201ENSMUST00000021851 2402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Zfp408-202ENSMUST00000111333 3740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Med12-204ENSMUST00000117706 6940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Ube3bQ9ES34 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Flrt3-202ENSMUST00000110057 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Tnfrsf19-202ENSMUST00000111236 3958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Olfr702-204ENSMUST00000219803 1646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Mab21l3-201ENSMUST00000061831 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Gimd1-201ENSMUST00000163241 1413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Adgrg1-202ENSMUST00000179619 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Mrpl48-201ENSMUST00000064334 1865 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Naa11-201ENSMUST00000060265 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Gm45534-201ENSMUST00000211449 2339 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Olfr523-202ENSMUST00000209314 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Bdnf-210ENSMUST00000111051 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Gm28497-201ENSMUST00000189646 3029 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Tnfrsf11b-201ENSMUST00000079772 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube3bQ9ES34 Tex26-205ENSMUST00000201683 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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