Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm28266-201ENSMUST00000191410 439 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm37920-201ENSMUST00000192952 749 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm37841-201ENSMUST00000195367 376 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Epb41l2-202ENSMUST00000092645 4280 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm16487-201ENSMUST00000105048 4037 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm44669-201ENSMUST00000207774 1969 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 5830408C22Rik-203ENSMUST00000210596 326 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Nup133-201ENSMUST00000044795 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Ugt3a2-201ENSMUST00000072403 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Olfr975-202ENSMUST00000216647 2848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Nr3c1-202ENSMUST00000097592 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 AC165260.6-204ENSMUST00000225571 3508 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm5386-201ENSMUST00000121749 2450 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Esrrg-203ENSMUST00000110939 4833 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 AC154176.2-201ENSMUST00000225376 6429 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm29143-201ENSMUST00000189462 201 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 4932411K12Rik-203ENSMUST00000210384 1351 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gabrb3-206ENSMUST00000196198 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm38226-201ENSMUST00000192207 521 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms