Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Slx4ip-202ENSMUST00000099311 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Vmn2r-ps26-201ENSMUST00000202039 2111 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Adgrl3-216ENSMUST00000121641 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Adar-202ENSMUST00000098924 5909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Sdad1-203ENSMUST00000201143 2156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Grk3-201ENSMUST00000065167 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 A530041M06Rik-201ENSMUST00000199690 2288 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm45767-201ENSMUST00000212778 4561 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Alg8-201ENSMUST00000098300 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm5113-201ENSMUST00000085668 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Cntnap4-202ENSMUST00000118171 4860 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Zfp709-203ENSMUST00000188685 7186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Cacna1f-202ENSMUST00000115726 6079 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Ttc28-206ENSMUST00000156290 10688 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 AC123832.1-201ENSMUST00000214120 2371 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Zkscan5-202ENSMUST00000085671 3794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Grik2-205ENSMUST00000218598 3245 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Col4a5-202ENSMUST00000112931 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Eif2ak4-204ENSMUST00000110870 5116 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Lhx4-201ENSMUST00000027740 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Usp54Q8BL06 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 C5ar2-201ENSMUST00000098792 3429 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Eya3-213ENSMUST00000180250 5020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Wdr72-201ENSMUST00000055879 5196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Stag1-201ENSMUST00000041418 5909 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Trerf1-205ENSMUST00000190080 7045 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 AC130219.1-201ENSMUST00000228406 3433 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Adgrl3-208ENSMUST00000118442 5101 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Tnfrsf19-201ENSMUST00000111234 4051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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