Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Chn1os1-201ENSMUST00000123613 636 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm15941-204ENSMUST00000135401 726 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Defa-ps3-201ENSMUST00000142705 282 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm13269-201ENSMUST00000143458 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Fxyd5-207ENSMUST00000161684 1172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 U2af1l4-204ENSMUST00000163464 651 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm26929-201ENSMUST00000182703 753 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Mir6239-201ENSMUST00000183564 105 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Ly6a-202ENSMUST00000186526 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm20813-201ENSMUST00000186646 705 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Scgb2b30-201ENSMUST00000187013 336 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Scgb2b10-201ENSMUST00000191403 318 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Mrpl22-201ENSMUST00000020820 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 1600027J07Rik-201ENSMUST00000209501 489 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps91-201ENSMUST00000213039 784 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 RMST_1.1-214ENSMUST00000220389 633 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 AC163660.3-202ENSMUST00000224917 464 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Olfr1499-201ENSMUST00000055672 1052 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Olfr984-201ENSMUST00000056795 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Tprkb-201ENSMUST00000067137 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 2700046A07Rik-202ENSMUST00000067450 2101 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 6330549D23Rik-203ENSMUST00000160818 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Prepl-201ENSMUST00000072406 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Cyp2c29-201ENSMUST00000003137 1783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Pkib-202ENSMUST00000075992 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm20045-201ENSMUST00000192658 5577 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Cyp19a1-203ENSMUST00000215736 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Skp2-202ENSMUST00000110585 6185 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Acsm5-201ENSMUST00000066465 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Fancd2os-201ENSMUST00000035870 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 1700074P13Rik-201ENSMUST00000031935 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm4451-201ENSMUST00000186000 1891 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Slc43a2-211ENSMUST00000169547 7145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Vgll1-203ENSMUST00000114746 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Pwp2-201ENSMUST00000042556 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Mgat4a-201ENSMUST00000042161 7030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Dmxl2-201ENSMUST00000118163 10614 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm45292-201ENSMUST00000211232 2207 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Arhgef7-202ENSMUST00000074856 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 5330416C01Rik-203ENSMUST00000144993 3287 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 C9-201ENSMUST00000022749 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm23358-201ENSMUST00000103887 110 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm26344-201ENSMUST00000104553 132 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm12594-201ENSMUST00000132140 499 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm13194-201ENSMUST00000142299 311 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm12055-201ENSMUST00000143643 793 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 4930526L06Rik-201ENSMUST00000181137 1022 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm7678-201ENSMUST00000181879 943 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Mir6912-201ENSMUST00000184456 70 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm27226-201ENSMUST00000184676 511 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm29439-201ENSMUST00000189996 509 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Tdpoz2-201ENSMUST00000191960 1145 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm5539-201ENSMUST00000192177 966 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 4930448I18Rik-201ENSMUST00000197958 736 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Crcp-206ENSMUST00000202756 600 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm44727-201ENSMUST00000204225 451 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Tmem147-206ENSMUST00000208169 537 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 2310008N11Rik-202ENSMUST00000210263 422 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Chmp2a-204ENSMUST00000211344 606 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Chmp2a-206ENSMUST00000211626 726 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm32688-201ENSMUST00000213849 585 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 AC123069.1-201ENSMUST00000215094 824 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 AC192333.4-201ENSMUST00000224269 981 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Timm8b-201ENSMUST00000044051 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Cox8c-201ENSMUST00000053611 458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Tas2r102-201ENSMUST00000069268 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Mir486-201ENSMUST00000093576 128 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Shprh-203ENSMUST00000159541 6679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms