Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

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Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gpbp1-202ENSMUST00000091236 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm9750-201ENSMUST00000142025 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Slc38a2-201ENSMUST00000023099 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Tbc1d24-206ENSMUST00000168410 7683 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Zfp207-208ENSMUST00000188489 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm42973-201ENSMUST00000197913 3200 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Grhl1-201ENSMUST00000020985 3070 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm14200-201ENSMUST00000122256 192 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm9280-201ENSMUST00000223155 517 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 AC122251.1-201ENSMUST00000227717 639 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Cyp2c29-201ENSMUST00000003137 1783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Tpd52l2-204ENSMUST00000108800 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Ypel2-201ENSMUST00000018571 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Olfr449-202ENSMUST00000204072 1974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm43430-201ENSMUST00000196513 3897 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Bdnf-208ENSMUST00000111049 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm29077-201ENSMUST00000185784 2169 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm28696-201ENSMUST00000189187 2169 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm28206-201ENSMUST00000190437 2169 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm28593-201ENSMUST00000190989 2170 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm37657-201ENSMUST00000195425 2169 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Ppp1r9a-204ENSMUST00000168998 2966 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Scn2a-205ENSMUST00000200829 6348 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Hecw1-201ENSMUST00000110516 9460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Fgf13-202ENSMUST00000119306 2091 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm44854-201ENSMUST00000205493 2340 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Cga-202ENSMUST00000108130 609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm16540-201ENSMUST00000160263 426 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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Usp9yF8VPU6 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Slc2a2-201ENSMUST00000029240 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 C5ar2-201ENSMUST00000098792 3429 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Vsnl1-202ENSMUST00000220506 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Med23-201ENSMUST00000020159 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Zfp472-201ENSMUST00000039132 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm6368-201ENSMUST00000119727 2147 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Ank2-201ENSMUST00000044443 5775 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Tmcc3-202ENSMUST00000117460 3217 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Adgrg7-201ENSMUST00000023437 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Tbx20-201ENSMUST00000052946 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Ehbp1-201ENSMUST00000045167 4821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm18631-201ENSMUST00000223125 1043 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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