Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Adgrl2-220ENSMUST00000200543 5509 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Folh1-202ENSMUST00000107271 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Trps1-206ENSMUST00000184458 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Maats1-202ENSMUST00000114740 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm8489-201ENSMUST00000209876 1152 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Adgrb3-201ENSMUST00000041838 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Usf3B2RUQ2 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Usf3B2RUQ2 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm12661-201ENSMUST00000118780 3335 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Epb41-201ENSMUST00000030739 6565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm40055-201ENSMUST00000196091 2742 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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