Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc6l2Q9JIM3 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc6l2Q9JIM3 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc6l2Q9JIM3 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc6l2Q9JIM3 Znrf1-210ENSMUST00000173781 337 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc6l2Q9JIM3 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc6l2Q9JIM3 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc6l2Q9JIM3 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc6l2Q9JIM3 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc6l2Q9JIM3 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc6l2Q9JIM3 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc6l2Q9JIM3 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc6l2Q9JIM3 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc6l2Q9JIM3 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc6l2Q9JIM3 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc6l2Q9JIM3 AC154347.1-201ENSMUST00000221358 3105 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc6l2Q9JIM3 Tpd52l2-204ENSMUST00000108800 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc6l2Q9JIM3 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc6l2Q9JIM3 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc6l2Q9JIM3 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc6l2Q9JIM3 Man2b1-201ENSMUST00000034121 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc6l2Q9JIM3 Gm36938-201ENSMUST00000191612 2696 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc6l2Q9JIM3 Helz2-201ENSMUST00000094203 9162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc6l2Q9JIM3 Inpp1-201ENSMUST00000027271 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc6l2Q9JIM3 Ndst3-206ENSMUST00000154668 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc6l2Q9JIM3 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26939-201ENSMUST00000177146 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc6l2Q9JIM3 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26512-201ENSMUST00000181874 3042 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm37920-201ENSMUST00000192952 749 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Nup188-201ENSMUST00000064447 5710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr523-202ENSMUST00000209314 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5493-201ENSMUST00000182063 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Lrrc29-204ENSMUST00000210801 3830 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Maats1-202ENSMUST00000114740 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Nup210l-202ENSMUST00000200410 5710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Coq8a-217ENSMUST00000170472 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Asb14-201ENSMUST00000090337 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Slc39a9-201ENSMUST00000085245 5201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr32-206ENSMUST00000215765 1241 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr32-201ENSMUST00000099755 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7972-203ENSMUST00000209180 2184 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Hmgxb4-201ENSMUST00000041759 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Htr5a-201ENSMUST00000036227 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Zfyve16-201ENSMUST00000022217 6150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Fam107a-201ENSMUST00000036070 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm38339-201ENSMUST00000195479 1829 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm38352-201ENSMUST00000194459 2557 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Sgsh-201ENSMUST00000005173 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr825-203ENSMUST00000216530 3502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Rimbp2-201ENSMUST00000111346 4264 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms