Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Mettl15-201ENSMUST00000081631 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Dlg2-203ENSMUST00000107193 4910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Tcp10c-201ENSMUST00000097403 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Depdc5-204ENSMUST00000119705 7929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Ncor1-201ENSMUST00000018645 9037 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Muc6-201ENSMUST00000062451 8650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Satb1-213ENSMUST00000169480 6194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Rag1-201ENSMUST00000078494 6608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Gprasp1-203ENSMUST00000113147 5611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Myt1-202ENSMUST00000108756 5509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Rttn-201ENSMUST00000023828 7268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Cdip1-201ENSMUST00000004173 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Myo16-202ENSMUST00000207204 6719 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Cdc42bpa-218ENSMUST00000212756 5247 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Mab21l3-201ENSMUST00000061831 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Srcap-207ENSMUST00000187040 10654 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Helz2-202ENSMUST00000108831 10109 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Smarcal1-207ENSMUST00000152225 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Eml1-201ENSMUST00000054955 3879 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nup155Q99P88 Fndc3b-204ENSMUST00000195008 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 AC164883.2-201ENSMUST00000227931 3815 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Olfr750-202ENSMUST00000216202 5789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Ikbkg-206ENSMUST00000114130 6736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Gm37496-201ENSMUST00000191930 2509 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Cfap44-202ENSMUST00000120049 6199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Mx1-201ENSMUST00000023655 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Ccdc169-201ENSMUST00000052904 2889 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Sema6a-201ENSMUST00000019791 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Smyd3-204ENSMUST00000128302 6871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Gm43254-201ENSMUST00000199187 2491 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Gm12187-201ENSMUST00000119584 1375 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nup155Q99P88 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms