Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45464-201ENSMUST00000210728 2844 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Krr1-203ENSMUST00000163048 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Dcn-202ENSMUST00000163448 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45737-201ENSMUST00000208344 1612 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr860-201ENSMUST00000086482 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Eml1-201ENSMUST00000054955 3879 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r44-212ENSMUST00000228183 1838 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 6530403H02Rik-202ENSMUST00000182124 3191 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Rab11fip3Q8CHD8 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Rab11fip3Q8CHD8 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Acad11-201ENSMUST00000047799 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 CT571245.1-201ENSMUST00000218642 3465 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab11fip3Q8CHD8 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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