Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm15160-201ENSMUST00000120553 907 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm13663-202ENSMUST00000145563 643 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm23079-201ENSMUST00000157847 117 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm7991-201ENSMUST00000168668 591 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm6536-201ENSMUST00000171180 615 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 1700039M15Rik-201ENSMUST00000195377 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Chil5-203ENSMUST00000200146 1296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Olfr890-201ENSMUST00000079804 945 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Rpl31-ps20-201ENSMUST00000080982 378 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Olfr224-201ENSMUST00000081102 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm44096-201ENSMUST00000203171 504 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Snx8Q8CFD4 Olfr715-201ENSMUST00000076958 1131 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms