Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Pbrm1-204ENSMUST00000090214 6212 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Btbd18-201ENSMUST00000133437 3052 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 St6galnac1-201ENSMUST00000009732 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Unc13d-202ENSMUST00000106450 4046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Syt2-201ENSMUST00000121990 6879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm44669-201ENSMUST00000207774 1969 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gpr156-201ENSMUST00000061274 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm28653-201ENSMUST00000185494 5276 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Sap130-201ENSMUST00000025109 4015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Clasp2-202ENSMUST00000163895 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Luzp1-203ENSMUST00000105849 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Hivep2-201ENSMUST00000015645 9763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Fam216b-201ENSMUST00000066437 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Mab21l3-201ENSMUST00000061831 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Lrrc15-201ENSMUST00000064606 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm44854-201ENSMUST00000205493 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Zfp532-208ENSMUST00000182852 5476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Iars-201ENSMUST00000047363 4396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Clasp1-214ENSMUST00000189570 5502 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Isy1-201ENSMUST00000089497 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Adamtsl1-209ENSMUST00000141889 7805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm33280-201ENSMUST00000193983 4340 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Zfp551-201ENSMUST00000080348 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 March6-201ENSMUST00000090227 6260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Dhx8-201ENSMUST00000039152 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Ap3m1-206ENSMUST00000154460 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm28758-201ENSMUST00000186123 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Ank2-201ENSMUST00000044443 5775 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gosr1-201ENSMUST00000010536 4289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Mpdz-201ENSMUST00000102830 7512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Tbx5-201ENSMUST00000018407 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Rgr-201ENSMUST00000022338 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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