Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 AC146596.1-201ENSMUST00000223507 223 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 CT009556.3-201ENSMUST00000226173 513 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm9837-201ENSMUST00000057722 731 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Krtap8-1-201ENSMUST00000072280 579 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SbdsP70122 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm15417-201ENSMUST00000126926 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 E130215H24Rik-201ENSMUST00000145525 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm15339-201ENSMUST00000153577 506 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm23822-201ENSMUST00000158739 128 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm37506-201ENSMUST00000192008 143 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm42932-201ENSMUST00000197280 744 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm26413-202ENSMUST00000198972 127 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm29918-202ENSMUST00000206036 258 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Pvrig-201ENSMUST00000211088 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 AC124687.3-201ENSMUST00000222865 875 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Mir24-2-201ENSMUST00000083607 107 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Rps12-ps3-201ENSMUST00000086764 494 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm5270-201ENSMUST00000121506 1002 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms