Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 AC158799.1-204ENSMUST00000217441 1321 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm25762-201ENSMUST00000103984 132 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Dtwd1-201ENSMUST00000110437 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 4930449I24Rik-201ENSMUST00000110598 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm12024-201ENSMUST00000118819 1253 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm5883-201ENSMUST00000120735 495 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm14414-201ENSMUST00000120833 573 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm12648-201ENSMUST00000126270 656 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Kbtbd8os-201ENSMUST00000135145 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm15343-201ENSMUST00000136382 640 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm22202-201ENSMUST00000158608 311 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Six3os1-213ENSMUST00000177487 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 9330179D12Rik-202ENSMUST00000180811 1001 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm29291-201ENSMUST00000186055 686 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm29561-201ENSMUST00000187838 631 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm29362-201ENSMUST00000187898 133 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Ly6e-208ENSMUST00000188042 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 1700036G14Rik-201ENSMUST00000189046 542 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm29175-201ENSMUST00000189500 402 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm29168-201ENSMUST00000189953 687 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Tdpoz2-201ENSMUST00000191960 1145 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm42884-201ENSMUST00000200729 422 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm44451-201ENSMUST00000203767 483 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Ndufa4-203ENSMUST00000204084 409 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Fxyd4-208ENSMUST00000204950 586 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 4930557K07Rik-201ENSMUST00000205110 363 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm3774-201ENSMUST00000209773 435 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Chmp2a-204ENSMUST00000211344 606 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Chmp2a-206ENSMUST00000211626 726 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 AC124585.1-201ENSMUST00000213334 953 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm35501-201ENSMUST00000213492 783 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 AC107663.2-201ENSMUST00000225534 1234 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Prap1-201ENSMUST00000026540 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Apoc2-201ENSMUST00000003074 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm9761-201ENSMUST00000075650 492 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 n-R5s28-201ENSMUST00000082814 119 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm26561-201ENSMUST00000180743 1413 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Mapk10-206ENSMUST00000133069 2732 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Cxcl5-201ENSMUST00000031318 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123 ms