Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm22661-201ENSMUST00000104192 132 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm5270-201ENSMUST00000121506 1002 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm13465-201ENSMUST00000129687 979 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm29195-201ENSMUST00000189038 379 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm29175-201ENSMUST00000189500 402 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm18943-201ENSMUST00000207357 1216 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm5815-201ENSMUST00000050706 1185 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Olfr517-202ENSMUST00000216500 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Mak-206ENSMUST00000225084 3573 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm1587-201ENSMUST00000100372 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Mir763-201ENSMUST00000103249 120 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm15417-201ENSMUST00000126926 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm23822-201ENSMUST00000158739 128 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm28888-201ENSMUST00000186556 316 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm5920-201ENSMUST00000187390 853 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm553-201ENSMUST00000189527 701 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Ly6c2-204ENSMUST00000191451 538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm37506-201ENSMUST00000192008 143 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm26413-202ENSMUST00000198972 127 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Cinp-209ENSMUST00000222457 723 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 CT009556.3-201ENSMUST00000226173 513 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 AC154257.1-201ENSMUST00000224811 1525 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
H2-Eb1P04230 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.8 ms