Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Med12l-202ENSMUST00000040325 10159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Olfr324-203ENSMUST00000216965 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Smim17-202ENSMUST00000160218 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm43507-202ENSMUST00000200281 2011 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gprasp2-201ENSMUST00000113136 3736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Mum1l1-203ENSMUST00000113043 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Mapk10-206ENSMUST00000133069 2732 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Star-201ENSMUST00000033979 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm19719-201ENSMUST00000200934 4230 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Aldh1l2-201ENSMUST00000020497 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm37367-201ENSMUST00000191771 2602 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 D630045J12Rik-201ENSMUST00000117556 10916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
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Tmf1B9EKI3 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Adgrf1-201ENSMUST00000047399 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Cep170-212ENSMUST00000194727 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Olfr443-ps1-202ENSMUST00000204422 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Plekhm3-201ENSMUST00000097713 8562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmf1B9EKI3 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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